17q21.31基因座H1单倍型通过内溶酶体通路介导铁死亡易感性的机制研究
《Cell Death & Disease》:Chr:17q21.31 locus risk haplotype H1 susceptibility to ferroptosis is mediated by endolysosomal pathway
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时间:2025年11月16日
来源:Cell Death & Disease 9.6
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本研究针对17q21.31基因座H1单倍型在神经退行性疾病中的风险机制,通过构建轻度慢性氧化应激模型,首次揭示H1神经元易感性源于铁死亡途径的激活,并阐明内溶酶体通路的关键调控作用。研究人员利用iPSC来源的神经元进行高通量药物筛选及多组学分析,发现FDA批准药物可逆转H1神经元的铁死亡表型,为神经退行性疾病的精准治疗提供新靶点。
神经退行性疾病(NDs)如阿尔茨海默病、帕金森病等,已成为全球第二大死亡原因,其发病机制与遗传因素和环境应激的复杂交互作用密切相关。全基因组关联研究(GWAS)反复证实,人类17号染色体q21.31区段(chr:17q21.31)的H1单倍型是多种NDs的显著风险因子,但其具体分子机制至今未明。该区域基因组结构复杂,存在大片段的倒位变异和大量单核苷酸多态性(SNP),且包含多个功能基因(如MAPT、CRHR1、NSF等),导致因果基因的鉴定困难重重。另一方面,氧化应激(OS)是NDs病理过程中的核心环节,然而传统研究多采用急性高浓度氧化应激模型,与疾病慢性进展的特征不符。因此,在遗传背景与慢性环境应激的交互框架下解析H1单倍型的风险机制,成为领域内亟待解决的关键科学问题。
为攻克这一难题,Eldem Sadikoglou等研究人员在《Cell Death and Disease》发表了题为“Chr:17q21.31 locus risk haplotype H1 susceptibility to ferroptosis is mediated by endolysosomal pathway”的研究。他们利用健康捐赠者来源的诱导多能干细胞(iPSC)分化为神经前体细胞(NPC)及成熟神经元,构建了轻度慢性氧化应激(MCOS)模型——通过持续1.5个月去除培养基中的抗氧化剂(AO)来模拟NDs中的慢性应激状态。研究团队采用高通量药物筛选(FDA批准化合物库)、活细胞时序成像、转录组测序(RNA-seq)及细胞形态学定量分析(Cell Painting)等技术,系统比较了H1、H2纯合及H1/H2杂合单倍型神经元的表型差异。
研究使用HipSci库提供的健康捐赠者iPSC系(每种单倍型3个独立生物学重复),通过小分子诱导分化为NPC,并利用Neurogenin 2(NGN2)慢病毒转导促进神经元分化。MCOS模型通过长期无抗氧化剂培养实现,药物筛选在96孔板中进行,采用Calcein-AM染色及高内涵成像系统定量神经元存活率。转录组分析使用纳米孔长读长测序技术,差异表达基因(DEG)通过DESeq2鉴定,通路富集分析涵盖Gene Ontology、KEGG、Reactome等数据库。溶酶体与活性氧(ROS)动力学研究采用特异性荧光探针(如pHLys-Red、Liperfluo)进行纵向活细胞监测。
通过Calcein-AM活性检测发现,在MCOS条件下,H1神经元存活率显著低于H2(p<0.0002),且神经毒性随AO剥夺时间延长而加剧(图1A)。
活细胞成像显示H1神经元轴突出现大量囊泡样膨大(blebs),与微管结构紊乱区域重叠(图1B-D),且死亡过程呈现时空传播的波样特征,符合铁死亡的典型模式(补充视频vS01-vS04)。
FDA库筛选发现,铁死亡抑制剂(如Deferasirox、Zileuton)可有效挽救H1神经元死亡,而凋亡或自噬抑制剂无效。结构相似性分析将活性化合物聚类为12类,文本挖掘富集分析显示,脂质代谢与铁死亡通路是主要靶点(图2E)。
剂量反应曲线(DRC)和总轴突长度(TAL)分析进一步验证了49种化合物在保护神经元形态与功能方面的有效性(图3A-B)。
细胞形态学定量分析(Cell Painting)显示,溶酶体数量在MCOS处理的H1神经元中显著增加(图4F-H),且主成分分析(PCA)中溶酶体相关特征贡献度突出(图4B-E)。
转录组分析发现,H2神经元中ARL17A(一种小GTP酶)表达显著上调,其互作蛋白网络富集于内吞作用与溶酶体运输通路(图5F)。差异表达基因富集分析进一步证实,H1与H2单倍型在谷胱甘肽代谢、铁-硫簇蛋白氧化及内溶酶体通路方面存在显著差异(图5G-J)。
纵向研究表明,H1神经元在分化早期(第3天)即出现ROS加速积累,而H2延迟至第6天(图6E-F)。溶酶体数量在H1中响应更剧烈,且动态变化时间点早于H2(图6H-I),提示H1单倍型内溶酶体稳态更易被破坏。
本研究首次在遗传背景与慢性应激交互框架下,证实17q21.31基因座H1单倍型通过内溶酶体通路调控铁死亡易感性。这一发现不仅解释了H1单倍型为何广泛关联于多种NDs,还为精准医学提供了新思路:针对内溶酶体-铁死亡轴的治疗策略(如ARL17A激动剂或溶酶体稳态调节剂)可能对H1携带者具有特异性疗效。此外,研究建立的MCOS模型与多模态分析平台,为复杂疾病遗传机制的功能解析提供了范式。
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