FUS纳米团簇:揭示液液相分离新中间态的独特物理特性与生物学意义
《Nature Communications》:FUS nanoclusters are a distinct state within the dilute phase
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时间:2025年11月13日
来源:Nature Communications 15.7
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本研究针对FUS蛋白液液相分离(LLPS)早期动力学机制不清的问题,通过优化预切割蛋白纯化技术,结合动态光散射(DLS)、荧光关联光谱(FCS)及单团簇下拉(SiCluP)等生物物理方法,首次系统表征了FUS在稀相中形成的纳米团簇(直径~300-500 nm)。该中间态具有瞬时形成、快速分子交换、抗1,6-己二醇溶解等特性,且其形成临界浓度(~200 nM)远低于饱和浓度(Csat)。研究明确了纳米团簇作为LLPS通路中的关键中间态,为神经退行性疾病相关蛋白聚集机制提供了新视角。
在细胞的生命活动中,蛋白质通过液液相分离(Liquid-Liquid Phase Separation, LLPS)形成无膜细胞器(如核仁、应激颗粒等),这一过程在基因转录、DNA损伤修复等生理过程中扮演关键角色。FUS(Fused in Sarcoma)作为一种高度无序的RNA结合蛋白,其相分离异常与肌萎缩侧索硬化症(Amyotrophic Lateral Sclerosis, ALS)等神经退行性疾病密切相关。然而,传统研究多聚焦于FUS浓缩相(如微米级液滴)的性质,对稀相中蛋白的早期组装行为知之甚少。尤其令人困惑的是,在低于饱和浓度(Csat)的条件下,FUS能否形成稳定的中间态?这些中间态是否具有独特的物理化学特性?这些问题成为理解FUS相分离路径与疾病关联的瓶颈。
为攻克这一难题,约翰斯·霍普金斯大学与哈佛医学院联合团队在《Nature Communications》发表最新研究,通过创新蛋白制备策略与高精度生物物理技术,首次揭示了FUS在稀相中形成的纳米团簇(nanoclusters)作为一种独立于浓缩相的中间态,其形成动力学、分子交换特性及化学耐受性均显著区别于传统液滴。这一发现不仅深化了对LLPS多步组装机制的理解,也为靶向相分离异常的药物开发提供了新思路。
研究团队首先优化了FUS蛋白纯化流程,通过预切割(Pre-Cleavage, PC)技术获得无标签FUS,避免了传统酶切(TEV Cleavage, TC)效率低对早期动力学测量的干扰。随后,他们整合动态光散射(DLS)、荧光关联光谱(FCS)和自开发的单团簇下拉(SiCluP)技术,系统量化了纳米团簇的尺寸分布、形成临界浓度、组装速率及分子交换动力学。此外,通过荧光恢复后漂白(FRAP)和化学扰动实验(如1,6-己二醇、NaCl处理),进一步揭示了纳米团簇的液体性质及其分子相互作用网络。
通过对比PC-FUS与TC-FUS的相行为,研究发现PC-FUS的纳米团簇形成临界浓度低至200 nM,远低于TC-FUS的1 μM。DLS与FCS数据一致表明,纳米团簇(直径100-1000 nm)在稀释条件下瞬时形成,且其尺寸随蛋白浓度增加而增大,直至达到Csat后出现微米级冷凝物。
SiCluP实验显示,纳米团簇在形成后30分钟内尺寸增长趋于平衡(直径约500 nm),而冷凝物则持续粗化。实时组装监测进一步证实,纳米团簇的组装速率显著低于冷凝物,表明二者受不同动力学机制调控。
通过双色标记纳米团簇混合实验与FRAP分析,研究发现纳米团簇内部分子可在秒级时间内与周围溶液交换,其表观扩散系数(Dapp)与冷凝物相当(~10?4 μm2/s),证明其具备液体样流动性。
高盐(>300 mM NaCl)可同时溶解纳米团簇与冷凝物,表明静电相互作用对两者稳定性均至关重要。然而,疏水干扰剂1,6-己二醇在0.2%浓度下即可破坏冷凝物,而纳米团簇在2%浓度下仍稳定存在,提示疏水作用在冷凝物形成中起主导作用,而非纳米团簇。
添加50聚尿苷酸RNA(U50)可加速纳米团簇向冷凝物转变,且纳米团簇尺寸随RNA浓度增加呈先增后减的“重入”效应。在ALS相关突变体(G156E)中,纳米团簇尺寸显著减小,暗示其与疾病病理的相关性。
本研究通过多尺度实验验证了FUS纳米团簇作为相分离路径中的关键中间态,其独特的形成阈值、动力学特性及化学耐受性均区别于传统冷凝物。纳米团簇的发现不仅完善了LLPS理论模型,还为解析病理条件下蛋白聚集的早期事件提供了新视角。未来针对纳米团簇与RNA或其他分子伴侣互作的研究,有望揭示其在神经退行性疾病中的具体作用机制。
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