一种由噬菌体编码的抗CRISPR蛋白会利用宿主的烯醇酶来阻止III型CRISPR免疫机制

《Nature Microbiology》：A phage-encoded anti-CRISPR protein co-opts host enolase to prevent type III CRISPR immunity

CRISPR防御机制通过AcrIIIA2蛋白劫持宿主烯醇酶形成三元复合物，阻碍病毒RNA结合，抑制CRISPR III型免疫应答，揭示宿主代谢酶参与抗病毒的新机制。

　　

摘要

CRISPR（规律间隔短回文重复序列）系统能够提供强大的适应性免疫，以抵御噬菌体感染。作为回应，噬菌体会利用抗CRISPR（Acr）蛋白来规避CRISPR的免疫机制。目前发现的少数III型Acr蛋白在对抗III型CRISPR免疫方面仅具有条件性效果，或者依赖于尚未明确或理解不足的抑制机制。本文报道了由嗜热链球菌噬菌体编码的III-A型Acr蛋白AcrIIIA2的发现。生化分析和结构研究表明，噬菌体AcrIIIA2利用宿主中大量存在的烯醇酶，与嗜热链球菌的III-A型（Csm）CRISPR核糖核蛋白复合物形成三元复合物，从而阻碍宿主的免疫反应。在烯醇酶的辅助下，AcrIIIA2阻断了噬菌体RNA的结合过程，进而防止了后续的III型抗噬菌体免疫反应。烯醇酶通过作为关键的结构支架来稳定Acr与CRISPR之间的相互作用，从而参与这一抗免疫过程。这些发现揭示了一种新的防御策略，即利用宿主中保守的因子来阻断CRISPR的免疫机制。