肿瘤驻留T细胞受体β V-补体决定区3-J氨基酸序列组装体的内在无序程度较高，这与更良好的黑色素瘤治疗结果相关

《Melanoma Research》：A high range of intrinsic disorder values for tumor resident, T-cell receptor beta V-complementarity determining region 3-J amino acid sequence assemblies correlates with better melanoma outcomes

转移性黑色素瘤预后评估中TRB内源无序性作为新型生物标志物的潜力研究。基于TCGA和NIH数据集，计算TRB V-CDR3-J序列内源无序性值，生存分析显示高值组生存优势显著，且低特定无序值与免疫检查点抑制剂耐药性相关。该研究为精准治疗提供新方向。

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摘要 通俗语言总结

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转移性黑色素瘤的治疗耐药性很高。尽管已经研究了多种因素对预后的影响，但本研究评估了T细胞受体β（TRB）多肽内在紊乱的潜在预后价值。从代表“癌症基因组图谱”（The Cancer Genome Atlas）和“皮肤黑色素瘤数据集”（Skin Cutaneous Melanoma dataset）的肿瘤RNA-seq文件中提取了TRB重组测序数据，以及来自美国国立卫生研究院（National Institutes of Health）的phs002683数据集的基因组学文件。计算了所有病例中TRB V-互补决定区3（CDR3）-J氨基酸序列的内在紊乱值。生存分析通过将病例分配到较高的或较低的第50百分位数组来评估总体生存率和疾病特异性生存率，这些分组是基于内在紊乱值进行的。对于phs002683数据集，比较了对抗免疫检查点抑制剂（ICIs）有耐药性的病例与没有观察到耐药性的病例之间的内在紊乱值。结果表明，内在紊乱值较高的第50百分位数与更好的预后结果相关。这一发现适用于两个不同的RNA-seq文件和重组测序提取算法，并且在两种不同的内在紊乱模型中也得到了验证。此外，较低的最小“各种长-3”值和“各种短-长-2”值与ICI治疗耐药性相关。本研究的结果表明，TRB V-CDR3-J组装的内在紊乱值多样性可能成为转移性黑色素瘤病例的一种新的预后生物标志物，并有可能用于指导个性化的治疗。

通俗语言总结：本研究探讨了T细胞受体β（TRB）多肽内在紊乱在转移性黑色素瘤（一种以治疗耐药性著称的癌症）中的预后潜力。研究人员分析了两个大型数据集的RNA-seq数据，以计算TRB序列的内在紊乱值。他们发现，内在紊乱值处于较高第50百分位数的病例具有更好的生存结果，而较低的最小“各种长-3”值和“各种短-长-2”值与对免疫检查点抑制剂（ICIs）的耐药性相关。这些发现表明，TRB序列的内在紊乱可能成为预测预后和制定个性化治疗的新型生物标志物。

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