瑞士废水样本中SARS-CoV-2病毒载量测量的决定因素及其时空变化结构:对未来监测工作的关键启示
《PLOS Water》:Determinants and spatio-temporal structure of variability in wastewater SARS-CoV-2 viral load measurements in Switzerland: Key insights for future surveillance efforts
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时间:2025年11月06日
来源:PLOS Water 2.8
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废水监测系统通过分析瑞士118个污水处理厂23,025份样本,揭示SARS-CoV-2病毒载量受实验室方法差异(最大量级差异达44,000倍)、人口年龄结构(65岁以上比例每增1个标准差病毒载量升11%)及空间相邻效应(贡献36%变异)等多因素影响。贝叶斯模型调整后,病毒载量与区域医院数据相关性从0.55提升至0.77,并识别出稳定地理集群结构。
这项研究围绕着废水基流行病监测(WBS)在瑞士2022年至2023年SARS-CoV-2疫情监控中的应用展开。研究团队对118个污水处理厂(WWTPs)收集的23,025个废水样本进行了分析,这些样本由8个独立实验室使用不同的浓度、提取和定量方法进行处理。研究发现,WBS数据的解读常常受到多种因素的影响,包括实验室操作方法、人口特征以及废水在处理过程中的变化。为了提高数据的可靠性和可解释性,研究采用了一种贝叶斯建模方法,通过固定效应和时空随机效应来区分不同来源的变异和偏差。
WBS作为一种新型的流行病监测手段,近年来在全球范围内得到了广泛应用。它通过检测社区废水中的病毒RNA来间接反映人群中的感染情况,而不需要依赖个体的临床检测数据。这种方式可以避免传统临床监测方法中存在的选择偏差,例如年龄、性别和经济状况等因素对检测覆盖率的影响。此外,WBS的覆盖范围更广,成本也相对较低,因此在疫情监控中具有重要的价值。WBS不仅可以用于大规模的社区监测,还可以应用于特定的场所,如医院、学校、大学校园或机场等,以追踪特定群体的感染情况。
然而,WBS数据的准确性仍然面临诸多挑战。首先,废水中的病毒浓度受到多种因素的影响,包括实验室分析方法的差异、人口特征的变化以及废水处理过程中的物理和化学因素。例如,不同实验室使用的标准曲线、目标蛋白(如N或S蛋白)以及处理流程中的储存时间等都会影响最终的病毒浓度测量结果。其次,人口特征,如年龄结构和经济地位,也会影响病毒在废水中的浓度。老年人群由于感染后病毒排泄时间更长、频率更高,可能在废水样本中表现出更高的病毒浓度。此外,工作场所的分布和人口流动模式(如通勤和旅游)也会影响废水中的病毒载量。
为了更准确地解读这些数据,研究团队采用了多种统计方法。首先,他们通过贝叶斯建模框架对病毒浓度进行调整,将实验室差异、人口特征和地理因素的影响分离出来。模型中包含了固定效应,如周末和节假日的影响,以及随机效应,如地理结构和时间趋势的变化。调整后的数据与地区内的新冠住院数据之间的相关性显著提高,从原始数据的0.55增加到调整后的0.77,这表明通过消除偏差,WBS数据能够更准确地反映疫情的真实情况。此外,研究还利用动态时间规整(DTW)聚类方法对调整后的数据进行分析,发现不同时间段内存在明显的地理聚集模式。
研究结果显示,WBS数据的调整后趋势在不同地区之间表现出一定的空间结构。例如,在疫情的早期阶段,瑞士的西北部地区显示出较高的病毒浓度峰值,而中部地区则相对较低。这种差异可能与人口免疫水平、接触模式或病毒变异引入的时间有关。随着疫情的发展,不同地区的病毒浓度趋于一致,但在后期又出现了新的地理聚集模式。这些模式可能反映了疫情后期的局部爆发或地区间不同的易感性、人口流动等因素。值得注意的是,某些地理聚集模式与语言区域相关,例如,某些集群主要由德语区构成,而另一些则包含法语或意大利语区,这可能暗示了与病毒传播相关的区域性特征。
此外,研究还发现,尽管对数据进行了调整,仍然存在一定程度的本地偏差。这种偏差可能与未被考虑的外部因素有关,如旅游业的波动。例如,在2022年夏季,旅游热点地区如劳特布伦嫩和格林德瓦表现出较高的病毒浓度,这可能与游客带来的感染有关。然而,由于数据的限制,研究团队无法完全量化这种影响。因此,未来的研究可以考虑引入其他指标,如酒店入住率或公共交通使用量,以更全面地评估人口流动对WBS数据的影响。
研究还指出,WBS数据的解读需要考虑到生态偏差的问题。由于WBS数据是基于污水处理厂的平均值,而非个体数据,因此可能存在对某些特定人群的误判。例如,高病毒浓度可能并不一定意味着更高的感染率,而是由于老年人群更频繁地排泄病毒。因此,在解释WBS数据时,需要结合当地的人口特征进行综合分析。
总的来说,这项研究强调了标准化实验室操作和先进数据处理方法在提高WBS数据可靠性方面的重要性。通过调整实验室差异、人口特征和地理因素的影响,研究团队能够生成更准确的病毒浓度趋势,这些趋势与实际的新冠住院数据高度相关。这不仅有助于更好地理解病毒的传播动态,也为公共卫生决策提供了更有力的依据。研究还指出,WBS数据的分析应结合多种因素,以避免误读和偏差,从而更有效地支持疫情监控和公共卫生政策的制定。
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