8-氧代-7,8-二氢鸟嘌呤可提高适配体对精氨酰胺的亲和力，其选择性氧化作用能促进交联的形成

《ChemBioChem》：8-Oxo-7,8-Dihydroguanine can Improve Aptamer Affinity Toward Argininamide and its Selective Oxidation Promotes Crosslinks Formation

该研究探讨将DNA aptamer识别位点中鸟嘌呤（G）替换为氧化损伤产物8-oxo-7,8-dihydroguanine（OG）对亲和力的影响，发现OG位置不同会导致亲和力增强、减弱或不变。同时，选择性氧化OG可高效形成aptamer-目标交联，但伴随非特异性交联，其机制可能与静电相互作用有关。

　　

摘要

本研究探讨了用氧化损伤产物8-氧代-7,8-二氢鸟嘌呤（OG）替换鸟嘌呤（G）碱基对针对L-精氨酰胺（L-Rm）选择的DNA适配体亲和力的影响。结果表明，根据修饰碱基在识别位点的位置不同，仅用OG替换一个G碱基可能会降低、不影响或增加这种亲和力。此外，还尝试在OG选择性氧化后促进适配体与其靶标之间的化学交联。实验发现，通过亲核加成L-精氨酰胺（可能作用于插入适配体中的OG碱基的C5位点），可以高效地产生这种交联；而原始适配体（不含OG）则不会发生交联。然而，由于该反应效率很高，L-精氨酰胺也会与本不应与其结合的寡核苷酸（包括随机序列）发生交联。这种现象可以通过带负电荷的寡核苷酸与质子化氨基酸之间的静电相互作用来解释，这种相互作用在OG氧化时有利于交联的形成。尽管采取了措施来减少这类非特异性交联的产生，但效果并不完全理想。

图形摘要

研究了将8-氧代-7,8-二氢鸟嘌呤（OG）引入针对精氨酰胺的DNA适配体中的效果。结果表明，OG的存在会根据其在识别位点的位置不同，增加、不影响或降低适配体对其靶标的亲和力。此外，选择性OG氧化被证明可以促进适配体与靶标之间的高效交联。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。