无转基因、经过基因编辑的卡文迪许香蕉(Musa acuminata,AAA)

《Plant Biotechnology Journal》:Transgene-Free, Gene-Edited Cavendish Bananas (Musa acuminata, AAA)

【字体: 时间:2025年10月30日 来源:Plant Biotechnology Journal 10.5

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  基因编辑、CRISPR/Cas9、瞬时编辑、无外源DNA整合、香蕉、白化表型、三等位敲除、选择压力、T-DNA、监管宽松

  这项研究聚焦于一种新型的基因编辑技术,特别针对香蕉品种Cavendish(如Williams和Grand Nain)进行改良。传统的基因编辑方法常常涉及将外源DNA整合到宿主基因组中,这在农业上可能引发监管限制和公众接受度的问题。为此,研究团队开发了一种无需外源DNA整合的基因编辑系统,旨在创建无转基因的基因编辑香蕉植株。该系统利用了Agrobacterium介导的瞬时基因编辑策略,结合了正向抗生素选择和负向选择机制,以筛选出不含整合T-DNA的编辑植株。

在实验中,研究者选择了两个与类胡萝卜素生物合成相关的内源基因作为目标:phytoene desaturase(pds)和lycopene β-cyclase(LCYb)。这些基因的编辑不仅有助于可视化基因编辑的效果,还能对香蕉的营养成分和抗病性产生积极影响。例如,pds基因的编辑会导致类胡萝卜素合成受阻,使植株呈现白化现象;而LCYb基因的编辑则会促使番茄红素在细胞中积累,导致细胞呈现粉红色。这种视觉标记对于快速评估基因编辑的成功与否具有重要意义。

为了实现这种瞬时编辑,研究团队设计了一种包含codA:nptII基因融合的T-DNA表达载体。在正向选择阶段,这些细胞会在48小时内受到抗生素卡那霉素的筛选,从而富集含有T-DNA的细胞。而在负向选择阶段,当细胞被5-FC处理时,由于codA酶的作用,会将5-FC转化为有毒的5-FU,导致含有T-DNA的细胞死亡。这种策略有效避免了外源DNA的长期存在,使得最终的基因编辑植株可能不携带任何转基因成分。

在实验中,研究者对多个基因编辑植株进行了分析。对于pds基因的编辑,共生成了32株植株,其中8株被证实含有编辑,并且极有可能不含整合的T-DNA。而针对LCYb基因的编辑,则生成了125株植株,其中34株被证实含有编辑。这些数据表明,该瞬时编辑系统在生成无整合DNA的基因编辑植株方面具有较高的效率,分别为17.6%至21.9%。

研究还发现,某些基因编辑植株可能包含不同的编辑类型,如小的插入或缺失、较大的删除,甚至是基因序列的倒置。这些不同的编辑类型在不同植株中呈现出不同的表型特征,例如白化植株或粉红色的细胞团。值得注意的是,某些植株虽然显示了编辑的迹象,但并未显示出明显的表型变化,这可能是因为编辑的基因并未对植株的表型产生显著影响,或者是因为编辑的基因在基因组中存在多个拷贝,部分拷贝被保留下来。

此外,为了验证这些基因编辑植株是否确实不含整合的T-DNA,研究者采用了靶向基因组测序和PCR筛查相结合的方法。通过对基因组DNA的分析,研究团队能够确认这些植株是否真正实现了无转基因的基因编辑。同时,他们还通过全基因组测序(WGS)进一步验证了编辑的完整性,并排除了外源DNA的存在。

该研究的意义在于,它为香蕉的基因改良提供了一种更为灵活和高效的策略。通过瞬时编辑技术,研究人员可以在不引入外源DNA的情况下,对目标基因进行精准的编辑。这不仅有助于规避转基因作物可能面临的监管障碍,还能够提高公众对基因编辑技术的接受度。此外,该方法还可以用于其他香蕉品种或相关作物的改良,从而推动农业上的可持续发展。

在实验过程中,研究者还对编辑后的植株进行了详细的表型和基因型分析。他们发现,一些植株虽然经历了基因编辑,但并未表现出显著的表型变化,这可能是因为编辑的基因在植物体内并未发挥关键作用,或者是因为编辑过程并未完全实现预期的基因功能丧失。然而,对于那些确实表现出白化或粉红色的植株,其基因编辑的效率较高,并且更有可能不含整合的T-DNA。

该研究还强调了瞬时编辑技术相较于传统稳定转化技术的优势。传统方法通常需要长期的抗生素筛选,这可能会对植物细胞的生长产生抑制作用,而瞬时编辑则采用较短的抗生素选择窗口,从而提高了编辑效率并减少了对植物生长的干扰。同时,由于没有外源DNA的长期存在,这种技术能够显著降低转基因作物可能带来的生态风险。

总的来说,这项研究展示了一种创新的基因编辑策略,能够有效提高香蕉基因改良的效率,并确保最终植株不含转基因成分。通过这种方法,研究人员能够探索更多的基因编辑可能性,为香蕉的农业改良和生物技术应用开辟了新的途径。该方法的实施不仅有助于应对香蕉种植过程中面临的病害问题,还能够提升香蕉的营养价值和市场竞争力。
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