探究摩洛哥饲养的绵羊品种中影响乳脂脂肪酸组成的基因的遗传多样性和结构动态

《Tropical Animal Health and Production》：Exploring genetic diversity and structural dynamics of genes influencing milk fatty acid composition in sheep breeds reared in Morocco

摩洛哥五种绵羊品种通过105个SNP分析揭示遗传多样性及地理适应差异，发现Beni Guil分化显著且部分SNP偏离Hardy-Weinberg平衡，乳脂代谢相关基因富集。样本量限制需谨慎解读。

　　

摘要

摩洛哥的羊品种展现出独特的适应性特征，这些特征受到多样化的遗传背景的影响，并受到该国复杂环境景观的塑造。在这项研究中，我们研究了在摩洛哥不同地理区域饲养的五个品种，分别是Beni Guil、D’man、Sardi、Timahdite和Ouled Djellal。我们检测到了105个高可信度的单核苷酸多态性（SNPs），这些SNPs位于与牲畜乳脂酸谱相关的18个基因中，而乳脂酸谱具有重要的营养和商业价值。我们根据这些SNPs评估了研究群体的遗传多样性以及其结构和分化情况。D’man品种的遗传多样性最低，近交程度最高；而Beni Guil品种与其他品种之间的分化程度最大。通过主成分判别分析，我们确定了导致Beni Guil品种差异的21个SNP变异。其中一些特定于该品种的SNP也显示出与哈代-温伯格平衡（Hardy-Weinberg Equilibrium）的偏差，这可能表明该品种长期适应了摩洛哥东部的高地环境。我们对含有这些特定于品种的SNP的基因进行了功能富集分析，发现最富集的生物学过程是细胞脂质代谢和脂肪酸转运。我们认识到，Beni Guil和Ouled Djellal的样本量较小，可能会影响等位基因频率估计的精确度以及特定于品种的结论的可靠性。在解释结果时我们考虑了这些限制因素，因此关于这两个品种的结论应在更大样本集得到验证之前谨慎对待。

摩洛哥的羊品种展现出独特的适应性特征，这些特征受到多样化的遗传背景的影响，并受到该国复杂环境景观的塑造。在这项研究中，我们研究了在摩洛哥不同地理区域饲养的五个品种，分别是Beni Guil、D’man、Sardi、Timahdite和Ouled Djellal。我们检测到了105个高可信度的单核苷酸多态性（SNPs），这些SNPs位于与牲畜乳脂酸谱相关的18个基因中，而乳脂酸谱具有重要的营养和商业价值。我们根据这些SNPs评估了研究群体的遗传多样性以及其结构和分化情况。D’man品种的遗传多样性最低，近交程度最高；而Beni Guil品种与其他品种之间的分化程度最大。通过主成分判别分析，我们确定了导致Beni Guil品种差异的21个SNP变异。其中一些特定于该品种的SNP也显示出与哈代-温伯格平衡的偏差，这可能表明该品种长期适应了摩洛哥东部的高地环境。我们对含有这些特定于品种的SNP的基因进行了功能富集分析，发现最富集的生物学过程是细胞脂质代谢和脂肪酸转运。我们认识到，Beni Guil和Ouled Djellal的样本量较小，可能会影响等位基因频率估计的精确度以及特定于品种的结论的可靠性。在解释结果时我们考虑了这些限制因素，因此关于这两个品种的结论应在更大样本集得到验证之前谨慎对待。