利用机器学习预测蝶呤类化合物和氟喹诺酮类药物生成过氧化氢(1O2)的量子产率

《Physical Chemistry Chemical Physics》:Predicting the quantum yield of 1O2 generation for pteridines and fluoroquinolones using machine learning

【字体: 时间:2025年10月28日 来源:Physical Chemistry Chemical Physics 2.9

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  机器学习模型预测氟喹诺酮和蝶啶类光敏化能力研究。通过分析48种FQs和Ptrs在D2O中的ΔΦ值,构建包含5000+分子描述符的模型。采用GA降维后,MLR、SVR、RFR等5种模型表现优异,SVR测试R2=0.975,XGBoost鲁棒性最佳。SHAP和ALE分析显示共轭最大键长(CMBL)和长程极化率(TDB09p)为关键预测因子,验证了线性与非线性模型的互补性,为光动力疗法新药设计提供理论支撑。

  

氟喹诺酮类(FQs)是一类以高光化学活性而闻名的抗生素药物:在紫外-可见光激发下,FQs 可以产生单线态氧和/或失去氟原子。蝶呤类(Ptrs)是一类有机光敏剂,即使在没有重金属(金属和卤素)的情况下,其生成单线态氧的量子产率也可达到 47%。由于 FQs 和Ptrs 的电子吸收光谱具有相似性,我们决定在同一研究中探讨它们的光化学性质:FQs 和Ptrs 都属于氮杂双环化合物。在本文中,我们描述并比较了适用于预测 FQs 和Ptrs 光敏能力的机器学习方法。我们研究了 48 种蝶呤类和氟喹诺酮类化合物在氘代水中的单线态氧生成量子产率(ΦΔ)。为了构建机器学习模型,我们选择了一个包含超过 5000 个分子描述符的数据集,这些描述符涵盖了量子化学和分子图论相关指标,并通过遗传算法(GA)对描述符的数量进行了优化。在模型开发和优化过程中,我们使用了多元线性回归(MLR)、支持向量回归(SVR)、随机森林回归(RFR)、梯度提升(GBR)和极端梯度提升(XGBoost)等技术。所建立的模型表现出较高的预测性能(R_train2 > 0.97,q2 > 0.84),其中 SVR 在测试集上的表现最佳(R_test2 = 0.975),而 XGBoost 具有最佳的总体鲁棒性。可解释性分析表明,不同模型中描述符的重要性各不相同。诸如共轭最大键长(CMBL)和长程极化率(TDB09p)等描述符被证实对 ΦΔ 有重要贡献。可解释性分析(SHAP 和 ALE)进一步证实了这些描述符的机制相关性,强调了线性模型和非线性模型的互补作用。这些结果证明了对结构多样的光敏剂进行统一建模的可行性,并为新型光动力治疗化合物的合理设计和虚拟筛选提供了实用见解。

图形摘要:利用机器学习预测蝶呤类和氟喹诺酮类化合物生成单线态氧的量子产率
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