基于图的半经验量子化学计算,采用GPU加速

《Journal of Chemical Theory and Computation》:GPU-Accelerated Graph-Based Semiempirical Quantum Chemistry

【字体: 时间:2025年10月28日 来源:Journal of Chemical Theory and Computation 5.5

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  基于图基的电子结构理论结合SEDACS与PySEQM,利用GPU加速实现分布式计算,显著提升大规模原子系统模拟效率,降低成本,并分析并行性能及计算精度。

  
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基于图的电子结构理论提供了一种可扩展的方法,用于利用分布式和混合计算平台研究大型、复杂的原子系统。我们展示了如何将基于图的线性缩放电子结构理论(该理论在Scalable Ecosystem、Driver和Analyzer for Complex Chemistry Simulations(SEDACS)中实现)与PySEQM代码中实现的半经验量子化学方法相结合,并利用图形处理单元(GPU)进行加速。这种强大的组合使得在多个节点上进行高效的、可扩展的电子结构计算成为可能,显著降低了计算成本,同时自然地利用了并行性。文章提供了关于并行化效率、计算精度和通信开销的详细分析,表明对于包含多达10,000个原子的系统,计算速度可以提高一个数量级。

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