利用基于CRISPR/Cas12a的RT-RPA技术快速且可视化地检测香菇球形病毒

《Virus Genes》：Rapid and visual detection of Lentinula edodes spherical virus using CRISPR/Cas12a-based RT-RPA

韩国裂褶菌中发现LeSV病毒，采用CRISPR/Cas12a结合RT-RPA方法，20分钟内完成检测，灵敏度比RT-PCR高100倍，现场验证显示优越性。

　　

摘要

香菇（Lentinula edodes）是一种全球重要的食用蘑菇，但病毒感染会阻碍菌丝生长、降低产量并降低品质，从而导致经济损失。本研究调查了韩国栽培的香菇中的病毒感染情况。我们开发了一种基于CRISPR/Cas12a的反转录-重组酶聚合酶扩增（RT-RPA）检测方法，用于快速准确地检测香菇球形病毒（LeSV），这种病毒是韩国感染香菇的主要真菌病毒。优化的RT-RPA-CRISPR/Cas12a检测方法在34°C条件下只需20分钟即可完成，其灵敏度比RT-PCR高100倍。实地样本验证进一步证实了该方法比RT-PCR具有更优的检测效果。本文描述的RT-RPA-CRISPR/Cas12a方法有助于早期诊断LeSV感染，并能支持香菇的病害管理。