Smeat-seq转录组分析揭示了母体向合子转变过程中的关键调控事件,并为藏羊胚胎的高效培养系统开发提供了支持

【字体: 时间:2025年10月28日 来源:Functional & Integrative Genomics 3.1

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  Zygotic基因激活在藏羊胚胎发育中起关键作用,体外培养条件下胚胎发育率随细胞阶段递减,4细胞期出现显著基因表达差异,核糖体生物合成上调与MAPK信号通路下调并存。

  

摘要

合子基因的激活在早期胚胎发育中起着关键作用,因为它决定了胚胎的潜力。通过卵切割方法收集的卵丘-卵母细胞复合体在38.5°C、5%二氧化碳和饱和湿度的条件下进行了24小时的体外培养。体外受精(IVF)后,培养在IVC中的胚胎的发育率分别为:2细胞期82.33%、4细胞期76.09%、8细胞期63.34%、桑椹胚期45.61%和囊胚期24.71%。对2细胞期、4细胞期和8细胞期的母源-合子基因转化进行Smart-seq转录组测序后发现,4细胞期存在显著的表达差异,其中差异表达基因的数量最多,主要集中在2细胞期和4细胞期之间。许多基因的显著上调表明在4细胞期发生了广泛的转录激活,以促进关键的发育过程;而大多数下调基因来源于母体。在真核生物中,核糖体生物合成途径是上调最显著的途径,这与MAPK信号通路的下调形成对比。KEGG分析显示,核糖体生物合成因子主要调控基因的转录、修饰和剪接,而MAPK信号通路的减弱则反映了该途径活性的降低。这项基于优化体外培养条件的早期藏羊胚胎测序分析为提高胚胎产量和支持该物种的辅助生殖技术提供了重要数据。

图形摘要

合子基因的激活在早期胚胎发育中起着关键作用,因为它决定了胚胎的潜力。通过卵切割方法收集的卵丘-卵母细胞复合体在38.5°C、5%二氧化碳和饱和湿度的条件下进行了24小时的体外培养。体外受精(IVF)后,培养在IVC中的胚胎的发育率分别为:2细胞期82.33%、4细胞期76.09%、8细胞期63.34%、桑椹胚期45.61%和囊胚期24.71%。对2细胞期、4细胞期和8细胞期的母源-合子基因转化进行Smart-seq转录组测序后发现,4细胞期存在显著的表达差异,其中差异表达基因的数量最多,主要集中在2细胞期和4细胞期之间。许多基因的显著上调表明在4细胞期发生了广泛的转录激活,以促进关键的发育过程;而大多数下调基因来源于母体。在真核生物中,核糖体生物合成途径是上调最显著的途径,这与MAPK信号通路的下调形成对比。KEGG分析显示,核糖体生物合成因子主要调控基因的转录、修饰和剪接,而MAPK信号通路的减弱则反映了该途径活性的降低。这项基于优化体外培养条件的早期藏羊胚胎测序分析为提高胚胎产量和支持该物种的辅助生殖技术提供了重要数据。

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