MAPK3 在急性髓系白血病中调节 SKAP2 的增强子-启动子相互作用

调控急性髓系白血病（AML）中基因表达的关键机制是CTCF介导的染色质相互作用，MAPK3通过影响CTCF结合上游SKAP2区域的增强子-启动子染色质互作发挥作用。研究采用IP-MS鉴定CTCF结合蛋白，发现MAPK3是重要结合蛋白；通过ChIP-seq验证MAPK3激活剂/抑制剂处理后CTCF在远端非编码区域的结合变化；3C-qPCR证实MAPK3活性调控CTCF介导的SKAP2增强子-启动子互作；CRISPR-Cas9敲除E4、E6增强子导致SKAP2表达下降。这为靶向MAPK3-CTCF染色质重塑治疗AML提供了新思路。

　　

摘要

通过染色质结构调控基因表达在急性髓系白血病（AML）中起着关键作用。本研究探讨了MAPK3对AML中CTCF介导的染色质相互作用的影响，重点关注基因调控和染色质结构。采用免疫沉淀结合质谱（IP-MS）技术鉴定AML细胞系中的CTCF结合蛋白。通过染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）分析了MAPK3激活剂或抑制剂处理后CTCF与DNA结合的变化。此外，还利用3C-qPCR技术评估了染色质相互作用，并使用CRISPR-Cas9技术删除了SKAP2位点上的特定增强子区域。结果表明，IP-MS确定MAPK3是关键的CTCF结合蛋白，表明其在AML染色质调控中的潜在作用。ChIP-seq进一步证实，MAPK3显著影响SKAP2上游基因间区域的CTCF结合。染色质相互作用分析显示，SKAP2处CTCF调控的增强子-启动子相互作用受到MAPK3活性的影响。删除增强子区域E4和E6后，SKAP2的表达水平降低。这些发现强调了MAPK3在调控CTCF介导的染色质相互作用中的关键作用，并提示靶向MAPK3调控的染色质重塑可能是治疗AML的新策略。

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