伊博加-吲哚生物碱作为潜在的疟原虫抑制剂：鉴定、生物合成及分子对接研究

《Chemistry & Biodiversity》：Iboga-Indole Alkaloids as Potential Plasmodial Inhibitors: Identification, Biosynthesis, and Molecular Docking Studies

抗疟活性新生物碱voacamine A及已知化合物从Voacanga africana树皮中分离，通过NMR和文献比对确认结构，评估其对氯喹敏感的Pf3D7疟原虫的抑制活性，IC50分别为5.73和5.32 μg/mL。提出双吲哚生物碱生物合成途径，并利用蛋白-配体共折叠和分子动力学模拟研究其与pfATP6蛋白的相互作用，揭示结构-活性关系，为开发新型抗疟先导化合物提供依据。

　　

摘要

从Voacanga africana的树皮中分离出一种此前未被描述的iboga-indole生物碱——voacamine A（1），以及已知的生物碱voacamine（2）、voacorine（3）和voacangine（4）。通过一维和二维核磁共振分析以及与已发表数据的比较，确定了这些生物碱的结构。评估了这些生物碱的抗疟原虫活性，实验对象是对氯喹敏感的3D7 Plasmodium falciparum（Pf3D7）菌株，测定了其半数抑制浓度（IC₅₀）。在测试浓度下，生物碱2和3表现出良好的体外抗疟原虫活性，其IC₅₀值分别为5.734 ± 1.365 μg/mL和5.319 ± 2.206 μg/mL。提出了一种合理的双吲哚生物碱生物合成途径。利用蛋白质-配体共折叠技术制备了针对pfATP6蛋白目标的蛋白质-配体复合物，并使用分子动力学模拟评估了这些复合物的稳定性。通过将生成的复合物与分子力学相结合的广义溶剂化校正方法，解释了所研究化合物的抗疟结构-活性关系。生物碱2和3可以作为设计新的抗疟原虫先导化合物的潜在骨架。

图形摘要

利益冲突

作者声明不存在利益冲突。