利用CRISPR/Cas12a集成离子电子生物传感器与疏水化纳米通道对m6 A修饰RNA的超灵敏检测:通过机器学习实现早期癌症诊断

《Analytical Chemistry》:Ultrasensitive Detection of m6 A-Modified RNA Using CRISPR/Cas12a-Integrated Iontronic Biosensor with Hydrophobized Nanochannels: Toward Early Cancer Diagnosis by Machine Learning

【字体: 时间:2025年10月24日 来源:Analytical Chemistry 6.7

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  m6A修饰检测新方法:融合CRISPR/Cas12a和CHCR链式反应的离子传感器实现超灵敏(32 aM)特异性检测,验证其在MALAT1和HOTAIR lncRNA癌症诊断中的应用,机器学习模型准确率达96.7%。

  
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N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物RNA中最常见的内部修饰类型,近年来由于其在校准基因发生、癌症进展和转移中的关键调控作用而成为研究的焦点。然而,传统的m6A修饰位点检测方法存在操作复杂、难以定量评估甲基化水平以及假阳性率较高的问题,严重限制了这些方法在临床和机制研究中的应用。在这项研究中,我们开发了一种超灵敏的离子电子生物传感器,该传感器基于疏水化的阳极氧化铝(AAO)纳米通道平台,将CRISPR/Cas12a系统的精准目标识别能力与夹心杂交链反应(CHCR)的高效信号放大技术相结合。这种集成方式使得能够以低至32 aM的检测限实现对m6A修饰RNA的超灵敏和特异性检测。针对MALAT1和HOTAIR lncRNAs的验证实验表明,该传感器在m6A修饰的定性分析中表现出极高的特异性。此外,同时检测这两种lncRNA能够有效区分癌症患者和健康个体。通过机器学习对潜在数据模式进行深入挖掘,随机森林(RF)模型的癌症诊断准确率达到了96.7%。这项研究为早期癌症诊断提供了一种新颖且有效的范式,对表观转录组学研究和临床应用具有深远的影响。

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