HLA匹配与CRISPR编辑HLA I/II类分子实现异体人调节性T细胞疗法在人源化小鼠移植模型中的成功植入和有效功能

【字体: 时间:2025年10月15日 来源:Nature Communications 15.7

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  本刊推荐:为解决异体调节性T细胞(Treg)疗法因宿主免疫排斥而失效的难题,研究人员通过HLA精准匹配和CRISPR基因编辑技术(敲除B2M和CIITA基因并插入HLA-E-B2M融合基因),成功构建了低免疫原性Treg。该细胞能同时规避T细胞和NK细胞的攻击,在单次低剂量输注后,于人源化小鼠模型中显著延长人皮肤移植物存活时间,其效果与自体Treg相当,为“现货型”异体Treg疗法的临床转化提供了关键技术支撑。

  
在自身免疫性疾病和移植排斥的治疗领域,调节性T细胞(Regulatory T cells, Treg)因其强大的免疫抑制功能而备受瞩目。然而,目前临床研究主要采用自体Treg疗法,即从患者体内分离Treg,在体外扩增后回输。这种方法存在诸多局限:患者个体间Treg数量和质量差异大,尤其对于年幼或年长患者,起始细胞数量可能不足;某些疾病本身可能导致Treg功能受损;体外扩增过程耗时数周,无法满足紧急治疗需求(如器官移植后的急性排斥反应);并且,个体化定制生产成本高昂,难以大规模推广应用。因此,开发来自健康供者的、预先制备好的“现货型”(off-the-shelf)异体Treg产品,成为突破当前瓶颈的关键。但异体细胞不可避免地会遭遇宿主免疫系统的攻击,如何让这些“外来客”在宿主体内存活并发挥功能,是亟待解决的核心科学问题。
为了回答这一问题,由Oliver McCallion、Weijie Du、Viktor Glaser等人领导的研究团队在《Nature Communications》上发表了他们的最新研究成果。他们系统评估了异体Treg面临的免疫排斥挑战,并创新性地结合人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigen, HLA)匹配策略和CRISPR基因编辑技术,成功构建了能够抵抗宿主T细胞和自然杀伤(Natural Killer, NK)细胞攻击的低免疫原性异体Treg,为通用型Treg疗法的开发铺平了道路。
研究人员为开展此项研究,主要应用了以下几项关键技术:利用流式细胞术分选和体外扩增人原代Treg;建立人皮肤异种移植-人源化小鼠模型以评估Treg体内功能;运用非病毒CRISPR/Cas9系统进行基因编辑(包括敲除B2M和CIITA基因,以及通过同源定向修复插入HLA-E-B2M融合基因);采用碱基编辑器(Adenine Base Editor, ABE)进行CIITA基因的精确沉默以消除HLA II类分子表达;通过体外抑制实验、细胞毒性实验(使用异体反应性T细胞系和原代NK细胞)评估Treg功能和存活;并利用空间转录组学(Spatial Transcriptomics)和免疫组织化学分析移植物内的免疫微环境。研究中使用的细胞来源于健康供者的外周血单核细胞(Peripheral Blood Mononuclear Cells, PBMCs)以及获得伦理批准的人皮肤组织。
研究结果
异体Treg在体外保持效力但在体内功效丧失
研究人员首先在体外比较了自体与异体Treg抑制PBMCs增殖的能力。结果表明,无论是在抑制CD4+还是CD8+ T细胞增殖方面,异体Treg与自体Treg的效果相当,且对反应细胞活化标志CD25的表达影响也无显著差异。这说明Treg的免疫抑制功能在体外是HLA非依赖性的。然而,在人源化小鼠皮肤移植模型中,情况发生了逆转。虽然Treg治疗均能延长移植物存活时间,但异体Treg的保护效果显著低于自体Treg(中位生存期81.5天 vs >100天),这与体外实验结果形成了鲜明对比。
体内CD8+ T细胞清除异体Treg
为了探究异体Treg体内功效降低的机制,研究人员进行了细胞存活实验。体外共培养实验中,异体Treg的存活率与自体Treg无差异。但在小鼠体内实验中,回收的异体Treg数量显著低于自体Treg。通过选择性剔除宿主PBMCs中的特定细胞亚群,他们发现剔除CD8+ T细胞能有效恢复异体Treg的回收数量和增殖能力至自体Treg水平,而剔除CD56+ NK细胞则无此效果。这表明异体Treg在体内的快速清除主要由宿主的CD8+ T细胞介导。
严格的HLA I类和II类匹配恢复异体Treg功效
既然CD8+ T细胞是清除异体Treg的主要元凶,而CD8+ T细胞的活化依赖于HLA I类分子的抗原呈递,那么进行HLA匹配是否可行?研究人员筛选了超过150对Treg/PBMC组合,评估了不同程度HLA匹配(完全错配、部分错配、部分匹配)的异体Treg在低剂量输注下的效果。结果显示,接受完全错配和部分错配异体Treg的小鼠迅速排斥了移植物,而接受部分匹配(HLA-A, -B, -C, -DR位点接近匹配)异体Treg的小鼠则大多实现了移物的长期存活(>100天)。这证明严格的HLA匹配可以克服异体排斥,但在临床实践中为每位患者寻找高度匹配的供者极具挑战性。
CRISPR多重编辑HLA I类和II类分子创建低免疫原性Treg
鉴于HLA匹配的临床局限性,研究人员转向基因编辑策略。他们利用CRISPR/Cas9技术,旨在消除Treg表面的多态性HLA分子,使其不被宿主T细胞识别。首先,他们敲除了B2M基因以消除HLA I类分子表达(II, B2M KO)。然而,缺乏HLA I类分子的细胞会因“缺失自我”(missing-self)信号而被NK细胞攻击。为此,他们在敲除B2M的同时,通过同源定向修复将非多态性的HLA-E基因与B2M外显子2连接,构建了HLA-E-B2M融合基因(IV, HLA-E KI),使细胞表面表达抑制性配体HLA-E。为了进一步消除HLA II类分子,他们在已进行HLA-E敲入的Treg上,使用腺嘌呤碱基编辑器(ABE8.20-m)靶向CIITA基因(V, HLA-E KI/CIITA KO, H/C Treg),成功阻断了HLA II类分子的表达。经过多重编辑的Treg(H/C Treg)仍保持典型的Treg表型(CD4+CD25+FOXP3+),FOXP3基因Treg特异性去甲基化区域(Treg-specific demethylation region, TSDR)保持低甲基化状态,并且在体外抑制实验中表现出与自体Treg相当的剂量依赖性抑制能力,且未产生过多的Th1型细胞因子。
HLA工程化Treg规避NK细胞裂解
功能实验证实,表达HLA-E-B2M融合基因的Treg(IV, HLA-E KI)相较于仅敲除B2M的Treg(II, B2M KO),能更有效地抵抗活化NK细胞的杀伤,显示出HLA-E提供的NK细胞抑制性信号起到了部分保护作用。
HLA编辑的Treg在体内促进移植物存活
在更具挑战性的体内模型中(完全HLA错配,低Treg剂量),未编辑的异体Treg无法保护皮肤移植物。而经过完全编辑的H/C Treg在过继转移后21天仍能在外周血中检测到,并且其促进移植物存活的效果与自体Treg相当。对移植物的分析显示,接受PBMC alone或PBMC加异体Treg治疗的移植物呈现出强烈的排斥特征,包括急性炎症反应相关转录本的高表达。相反,接受自体或HLA工程化异体Treg治疗的移植物则表现出免疫调节(如CD5L)、脂质呈递(如CD1A, CD1E)和组织稳态(如OGN, ARFGEF3)相关基因的富集,且细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocytes)浸润显著减少,细胞异质性得以保持。
结论与讨论
本研究有力地证明了通过两种策略可以克服异体Treg疗法面临的体内排斥障碍:一是近乎完全的HLA匹配,二是通过CRISPR多重基因编辑同时消除HLA I类和II类分子并引入NK细胞抑制性配体HLA-E。这两种策略均能显著延长异体Treg在宿主体内的存活时间,使其能够建立有效的免疫调节环境,最终实现与自体Treg相当的移植物保护效果。HLA匹配策略虽然有效,但供者寻找困难,限制了其作为“现货型”产品的广泛应用。因此,HLA基因编辑提供了一条更具可行性和可扩展性的临床转化路径。
研究还指出,HLA编辑的Treg其免疫抑制功能可能通过T细胞受体(T Cell Receptor, TCR)依赖和非依赖途径共同发挥作用。未来的研究可考虑在低免疫原性的基础上,进一步引入靶向特定抗原的嵌合抗原受体(Chimeric Antigen Receptor, CAR),以增强其靶向性和效力。同时,研究人员也谨慎地提到,完全消除HLA分子可能带来的潜在风险,如对细胞内病原体或恶性转化的免疫监视减弱,因此在临床推进中考虑加入安全开关(safety switch)是必要的。
总之,这项研究标志着向“现货型”异体Treg细胞疗法临床转化迈出了关键一步。它不仅为移植耐受诱导提供了新策略,其揭示的机制——即通过基因编辑赋予细胞低免疫原性以抵抗宿主免疫攻击——也具有更广泛的适用性,有望应用于其他免疫介导的疾病治疗中。未来的工作将聚焦于优化编辑策略以提高效率和安全性,并探索其在更多疾病背景下的治疗潜力。
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