对Haematoxylum campechianum L.的线粒体和叶绿体基因组进行完整测序,揭示了基因转移和RNA编辑事件的有关信息

《Industrial Crops and Products》:Complete mitochondrial and chloroplast genomes of Haematoxylum campechianum L. reveal insights into gene transfer and RNA editing events

【字体: 时间:2025年10月09日 来源:Industrial Crops and Products 6.2

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  铁刀木线粒体和叶绿体基因组测序及分析,揭示其基因组结构特征、系统发育拓扑不一致性及RNA编辑位点,为Caesalpinioideae亚科研究提供重要资源。

  
沈诗雅|谢一宁|胡子健|吴伟倩|李毅|沈伟伟|吴杰|宋玉双|张曦|林金星

摘要

红木(Haematoxylum campechianum L.)是一种具有多种药用价值的经济价值较高的树种。然而,红木的细胞器基因组至今尚未被阐明,这阻碍了云实亚科(Caesalpinioideae)内的系统发育研究和比较分析,同时也限制了对其生物活性代谢物合成途径的遗传学研究。在这项研究中,成功组装并注释了H. campechianum的线粒体基因组(mitogenome)和叶绿体基因组。研究结果显示,红木的线粒体基因组长度为672,957 bp,包含36个蛋白质编码基因(PCGs)、23个tRNA和3个rRNA。相比之下,红木的叶绿体基因组长度为157,156 bp,包含79个PCGs、28个tRNA基因和4个rRNA基因。此外,系统发育重建显示基于线粒体和叶绿体的基因树之间存在拓扑不一致性,这归因于线粒体突变率的加速。研究还鉴定出16个线粒体-质体DNA片段,证明了细胞器间的基因转移现象,并发现了286个预测的RNA编辑位点,其验证率为87.23%。总体而言,本研究为云实亚科提供了宝贵的细胞器基因组资源,阐明了其系统发育关系,并为探究红木的进化提供了重要依据。
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