LINC01432-CELF2轴作为凋亡抑制因子：揭示多发性骨髓瘤治疗抵抗的新机制与靶向策略

本期推荐：多发性骨髓瘤（MM）患者常因治疗抵抗导致预后不良。本研究通过转录组分析发现LINC01432 IncRNA在短期无进展生存（PFS）患者中显著上调，其通过与RNA结合蛋白CELF2互作，抑制干扰素响应和凋亡通路，促进肿瘤存活。靶向LINC01432可诱导凋亡并抑制肿瘤生长，为克服MM耐药提供了新靶点。

　　

多发性骨髓瘤（MM）作为一种浆细胞恶性肿瘤，至今仍无法治愈，每年全球有数万新发病例。尽管蛋白酶体制剂、免疫调节药物等标准疗法不断进步，但几乎所有患者最终都会复发，疾病进展的分子机制尚不明确。尤其令人关注的是，长链非编码RNA（lncRNA）在MM耐药和预后中的作用仍属未知领域。

为填补这一空白，华盛顿大学研究团队对135例新诊断MM（NDMM）患者样本进行转录组测序，比较了短期无进展生存（PFS<24个月）与长期PFS（>24个月）患者的lncRNA表达谱。他们发现157个lncRNA在短期PFS患者中显著上调，并从中选择了表达差异最显著的LINC01432进行功能机制研究。

研究人员采用CRISPR/Cas9技术敲低LINC01432表达后，发现与干扰素-α/γ响应相关的基因被激活，细胞凋亡显著增加。使用锁核酸反义寡核苷酸（LNA ASO）靶向LINC01432同样能诱导凋亡，而这种效应可通过LINC01432过表达进行挽救。机制研究表明，LINC01432直接结合RNA结合蛋白CELF2，转录组分析显示两者共同调控108个重叠靶基因，这些基因参与免疫激活、应激响应和细胞存活等重要生物学过程。

本研究主要采用以下关键技术方法：1）基于MMRF CoMMpass队列的RNA测序数据分析；2）CRISPR/Cas9和LNA ASO基因敲低技术；3）染色质分离RNA质谱（ChIRP-ms）和RNA免疫沉淀（RIP）验证RNA-蛋白相互作用；4）多色荧光原位杂交（mFISH）分析亚细胞定位；5）体内骨髓瘤模型评估肿瘤生长。

LINC01432在短期PFS患者中上调并调控免疫响应和骨髓瘤相关通路

研究发现LINC01432在短期PFS患者中表达显著升高（log₂FC=6.42），且与t(14;16)和Amp(1q)等高风险遗传异常正相关。体外实验表明，美法仑治疗可显著诱导LINC01432表达。RNA测序分析显示，LINC01432敲低后314个基因上调、90个基因下调，其中包括BDNF、CCR7、GDF15等多个MM相关基因。基因集富集分析（GSEA）表明干扰素响应、TNF-α信号和p53通路被激活。

LINC01432抑制凋亡并促进肿瘤生长

通过mFISH证实LINC01432在NDMM患者骨髓样本和细胞系中高表达，主要定位于细胞核和细胞质。CRISPR敲低LINC01432显著增加细胞凋亡（p<2.78e-07），而过表达则减少凋亡。体内实验显示，敲低LINC01432的细胞形成肿瘤体积较小（第42天p=0.02），而过表达细胞形成肿瘤更大（第35天p=0.0003）。

LNA ASO介导的LINC01432敲低诱导凋亡

使用两种LNA ASO敲低LINC01432均显著增加caspase-3/7活性和凋亡率（p<1.96e-05），而过表达可挽救此表型。这表明靶向LINC01432具有治疗潜力。

LINC01432与CELF2 RNA结合蛋白结合

通过POSTAR3数据库预测和实验验证，发现CELF2与LINC01432直接结合。ChIRP-ms和Western blot证实两者相互作用，iCLIP分析确定了结合的具体区域。RIP实验显示LINC01432在核质中均与CELF2富集，mFISH证实两者在患者样本中共定位。

LINC01432和CELF2共同调控免疫相关和凋亡基因网络

CELF2敲低产生2165个差异表达基因，与LINC01432敲低共享108个靶基因，其中41.7%为lncRNA。这些共享基因包括CCR7、BDNF、CXCL9等免疫调节因子。双重敲低LINC01432和CELF2可协同增强凋亡效应，证明两者在促进细胞存活中的功能联系。

研究结论表明，LINC01432-CELF2轴通过抑制干扰素刺激基因和凋亡相关通路，促进多发性骨髓瘤细胞存活。这一发现不仅为MM治疗抵抗提供了新的分子机制解释，也揭示了靶向LINC01432的治疗潜力。研究人员指出，lncRNA的组织特异性表达模式使其成为RNA治疗的理想靶点，而LNA ASO技术为靶向lncRNA提供了有效手段。

这些发现强调了LINC01432-CELF2轴作为MM治疗抵抗的关键调节机制，为开发针对高危多发性骨髓瘤的新治疗策略提供了理论基础。未来研究将进一步探索这一轴在肿瘤微环境中的作用及其与其他治疗方式的协同效应，为克服MM耐药性提供新思路。

该研究发表于《Oncogenesis》（2025年14卷36期），由Richa Mishra、Prasanth Thunuguntla等研究人员共同完成，通讯作者为Jessica Silva-Fisher。