低盐环境下，Penaeus vannamei 肝胰腺对 Lactococcus garvieae 感染的转录组分析

《Journal of Fish Diseases》：Transcriptome Analysis of Penaeus vannamei Hepatopancreas in Response to Lactococcus garvieae Infection in Low Salinity

白对虾在低盐（5 ppt）和高挥发性乳酸菌感染下通过RNA-Seq分析鉴定出294个差异转录本（234↑/60↓），GO分析显示肽酶抑制和调节相关生物过程显著富集，KEGG通路分析揭示ECM受体相互作用通路上调，而糖异生和代谢通路下调，关键基因包括整合素β PS3、层粘连蛋白、胶原蛋白及血纤维蛋白原。

　　

摘要

Lactococcus garvieae感染会显著影响白虾Penaeus vannamei的健康，尤其是在低盐度条件下（5 ppt）。尽管白虾是一种广盐性物种，但在低盐度环境下它们更容易受到压力因素的影响，这可能导致水产养殖系统中的疾病爆发。在这项研究中，我们对暴露于低盐度和L. garvieae环境下的虾的肝胰腺组织进行了RNA-Seq分析。差异转录本分析发现了294个转录本：在双重压力条件下，有234个转录本上调，60个转录本下调。基因本体论（GO）分析表明，许多差异表达的基因与生物过程有关，尤其是肽酶抑制和调控活性。此外，京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析显示，ECM-受体相互作用通路上调，而与糖异生和代谢相关的通路下调。ECM-受体通路涉及关键基因，如整合素β PS3、层粘连蛋白、胶原蛋白和血栓调节蛋白（THBS）。这项研究为了解虾对L. garvieae感染和低盐度压力的分子响应提供了见解。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。