比较基因组学分析揭示了卵胎生硬骨鱼类黑岩鱼（Sebastes schlegelii）维持妊娠的机制

《Marine Biotechnology》：Comparative Genomics Analysis Provides Insights into Pregnancy Maintenance Mechanisms in the Ovoviviparous Teleost Black Rockfish (Sebastes schlegelii)

黑岩鱼（Sebastes schlegelii）卵胎生繁殖机制研究通过比较基因组学分析发现374个谱系特异性基因家族，涉及细胞信号、代谢调节等；73个基因家族显著扩张，与ECM结构和神经调节相关；164个基因在正选择压力下与线粒体功能、代谢途径及血管生成关联。转录组数据揭示ECM重塑和血管生成在妊娠期卵巢基质组织中的关键作用，为解析卵胎生遗传适应机制提供新证据。

　　

摘要

黑岩鱼（Sebastes schlegelii）是一种在中国水产养殖中具有重要经济价值的卵胎生硬骨鱼类，其独特的繁殖策略表现为体内受精以及胚胎在雌性体内长时间发育直至活体出生。然而，由于对妊娠（此处指Sebastes schlegelii的卵巢内妊娠）维持机制的了解不足，这种繁殖方式在人工繁殖实践中面临诸多挑战。在本研究中，我们对Sebastes schlegelii与典型的卵生及卵胎生鱼类进行了比较基因组分析，鉴定出374个与细胞信号传导、代谢调控、免疫反应和发育过程相关的谱系特异性基因家族。此外，还发现了73个基因家族发生显著扩增，这些基因主要参与细胞外基质（ECM）的结构与调控以及神经调节。另有164个基因可能与线粒体功能、代谢途径和血管生成有关，并经历了强烈的正选择。值得注意的是，利用第五期卵巢、视泡期及卵巢间质组织的转录组数据，检测到了与ECM结构与调控及血管生成相关的候选功能基因的表达谱，这突显了妊娠期间ECM重塑和血管生成的关键作用。这些发现为Sebastes schlegelii妊娠维持的分子机制提供了新的见解，并有助于更深入地理解卵胎生硬骨鱼类在妊娠过程中的遗传适应性。