头颈鳞癌预后新突破:生物信息学与深度学习联袂揭示诊断生物标志物组合
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时间:2025年10月02日
来源:Journal of Applied Genetics 1.9
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本研究针对头颈鳞状细胞癌(HNSCC)异质性高、晚期预后差的问题,通过整合生物信息学与深度学习算法,筛选出KRT33B、C14orf34和ACADM等关键差异表达基因(DEGs)。研究构建的ROC曲线显示三基因组合诊断效能优异(AUC=0.93),为HNSCC精准诊疗提供新策略。
头颈鳞状细胞癌(Head and Neck Squamous Cell Carcinoma, HNSCC)作为全球第七大常见癌症,其发生与不良生活方式密切相关。尽管癌症治疗手段不断进步,I–II期患者5年生存率达70–90%,但III–IV期患者生存率骤降至40%左右,这一差异凸显了HNSCC的高度异质性。
通过结合生物信息学与机器学习技术,研究人员从RNA表达数据中筛选出显著差异表达基因(Differentially Expressed Genes, DEGs),并利用深度学习算法进一步识别出变异显著的基因。研究还分析了DEGs与临床数据的关联性,构建了受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic, ROC)曲线,并预测了肿瘤浸润免疫细胞分布。
深度学习分析鉴定出与致癌机制密切相关的诊断和预后生物标志物,包括KRT33B、KRTAP3-3、C14orf34和ACADM。ROC曲线分析表明,ACADM、KRT33B与C14orf34的组合是最具实用性的诊断标志物组合,其敏感性、特异性和曲线下面积(Area Under the Curve, AUC)分别达到0.92、0.86和0.93。这一发现为HNSCC的早期诊断和个体化治疗提供了新的分子靶点。
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