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本文全面综述了大肠杆菌外膜通道蛋白 TolC 的研究进展。TolC 在抗菌耐药、代谢、膜完整性和宿主生存等方面具有重要作用。文章梳理其发现历程、结构功能、调控机制等,指出研究空白,为后续探究提供方向,助力相关领域深入研究。
引言
自近 60 年前发现以来,TolC 在大肠杆菌中就与多种细胞功能相关。它能外排环境应激物和毒力因子,还可作为特定噬菌体和大肠杆菌素 E1 毒素的受体。本文回顾过去六十年的关键发现,探讨 TolC 在大肠杆菌生理功能中作用的研究现状与不足。
TolC 的结构与组装
TolC 是大肠杆菌中一种独特的外膜通道蛋白,由三个原聚体组装形成跨越外膜和周质的 “通道隧道”。其上部是 12 链 β - 桶结构,由每个原聚体的 4 条 β - 链构成,与其他大肠杆菌外膜蛋白结构不同。独特的 α - 螺旋桶从 β - 桶延伸到周质,通道内部有较大空腔,在蛋白 H 处约 100 ? 的范围内保持约 20 ? 的内径,向周质端半径缩小至约 2 ?,由 α - 螺旋缠绕形成封闭结构123。
在组装过程方面,TolC 在细胞质中合成,带有 N 端信号肽,通过 Sec 转位酶进入周质。与大多数外膜蛋白不同,TolC 似乎遵循独特的组装途径,不依赖已知的伴侣蛋白。其折叠涉及两个中间体,先形成主要为 α - 螺旋的单体,再组装成三聚体,之后由转运和组装模块(TAM)和 β - 桶组装机器(BAM)复合物协助插入外膜,但具体分子机制仍有待进一步研究456。
大肠杆菌中的其他外膜通道蛋白
大肠杆菌除 TolC 外,还编码 CusC、MdtP 和 MdtQ 三种同源外膜通道蛋白。CusC 是 CusCFAB 阳离子外排系统的一部分,参与铜和银离子的排出;MdtP 和 MdtQ 功能尚未明确,但敲除相关基因会使大肠杆菌对嘌呤霉素、吖啶黄和四苯基氯化砷的敏感性增加,暗示它们可能参与物质运输789。
这些蛋白与 TolC 的氨基酸序列相似性较低,但结构同源。通过距离矩阵比对(DALI)发现,CusC 与 TolC 结构高度相似,MdtP 和 MdtQ 的预测结构也与 TolC 相似,不过还需实验验证。它们在大肠杆菌核心基因组中高度保守,表明在进化过程中具有重要作用,未来研究应关注其在细菌生理和适应过程中的具体功能101112。
TolC 表达的调控
TolC 的表达受复杂网络调控,每个大肠杆菌细胞约含 1500 个 TolC 蛋白分子,在环境刺激下数量会增加。其调控涉及四个启动子(p1、p2、p3 和 p4),属于 marA、soxS 和 rob(marA/soxS/rob)转录调节子。MarA、SoxS 和 Rob 能与靶基因启动子中的 marbox 结合,激活 TolC 从 p3 和 p4 启动子的表达131415。
p1 和 p2 启动子位于 marbox 上游,受其他转录调节子控制。p1 的调控机制尚不清楚,p2 受 PhoPQ 和 EvgAS 双组分系统调控。PhoPQ 在低浓度二价阳离子(如 Mg2+)条件下激活,调节与细胞包膜应激相关的基因;EvgAS 通过激活 PhoPQ 间接控制 TolC 表达。此外,AcrR 作为全局抑制子间接抑制 TolC 表达,小调节 RNA(sRNA)SdsR 在稳定期大量表达,可在转录后抑制 TolC 表达1617。
TolC 的多样功能
- 抗菌耐药:TolC 是外排机制的基本组成部分,通过与耐药 - 结节 - 细胞分裂(RND)、ATP 结合盒(ABC)和主要促进超家族(MFS)外排泵形成三元复合物,赋予大肠杆菌广泛的抗菌耐药性。它能间接促进水平获得的耐药机制,在抗菌剂存在时有助于形成持留菌。TolC 被认为是非选择性的,底物特异性源于外排泵及其周质适配蛋白,但 TolC α - 螺旋桶周质端内表面带负电,可能影响底物运输,且部分残基与底物特异性有关1819。
- 介导内源性生理底物的外排:除了排出外源性抗菌化合物,TolC 还参与多种内源性化合物的外排,如在微生物竞争中排出抗菌肽(如大肠杆菌素 V 和微菌素 J25),与内膜药物外排泵协同参与代谢物外排,如铁载体肠杆菌素。肠杆菌素因分子较大无法通过孔蛋白扩散,TolC 参与其外排,敲除 tolC 会影响大肠杆菌在缺铁条件下的生长。此外,TolC 还与卟啉、活性氮物种等代谢物的外排有关202122。
- 维持细胞包膜完整性:TolC 与大肠杆菌细胞包膜的完整性和功能密切相关。tolC 突变体中,外膜蛋白 OmpF 水平降低,这是由于 mar - sox - rob 调节子上调,特别是 Rob 增加了 MicF 的表达,MicF 与 ompF mRNA 结合抑制其翻译。tolC 突变体对多种抗菌剂敏感性增加,除了外排功能丧失,还会导致细胞包膜结构和力学性能改变。研究发现,敲除 tolC 会使大肠杆菌对脂多糖(LPS)运输的扰动更敏感,tolC 突变体在 LPS 结构和外膜不对称组织方面可能存在变化,但 TolC 在 LPS 成熟组装中的具体作用机制仍不清楚232425。
- 毒力、致病性和宿主相互作用:TolC 是 I 型分泌系统(T1SS)的关键组成部分,有助于分泌毒力因子,增强致病性大肠杆菌在宿主组织中的定植、侵袭和持续存在能力。例如,溶血性大肠杆菌的 α - 溶血素(HlyA)分泌依赖于由 HlyB、HlyD 和 TolC 组成的 T1SS。TolC 还与细菌的聚集、粘附、生物膜形成以及酸抵抗有关,在大肠杆菌抵抗宿主胃肠道酸性环境中发挥重要作用,但相关具体机制仍有待深入研究2627。
结论
TolC 在大肠杆菌生理学中发挥着重要作用,涉及多药耐药、膜完整性、酸生存和 T1SS 功能等多个方面。尽管对 TolC 的研究已有数十年,但仍有许多功能未被充分研究。其折叠和插入外膜的过程、与其他外排系统及 T1SS 相互作用的分子细节、在细胞包膜完整性和 LPS 组成中的具体机制,以及在酸抵抗中的分子机制等,都需要进一步研究。这些研究将有助于深入理解大肠杆菌的生理过程,为开发新型抗菌策略提供理论依据。