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多功能的全玻片扫描成像系统
【字体: 大 中 小 】 时间:2024年08月26日 来源:基因有限公司
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MMI CellScan全玻片扫描成像(WSI)系统可以实现5D全玻片扫描成像;可以兼容各种生物样本;灵活使用开放的BigTIFF文件格式,且可以无限制地安装免费MMI CellViewer软件,帮助研究人员用于各种实验目的。
MMI CellScan全玻片扫描成像(WSI)系统可以实现5D全玻片扫描成像,包括X、Y轴方向、Z-Stack、多色荧光以及延时拍摄;可以兼容各种生物样本,包括新鲜冷冻组织、FFPE样本、活细胞样本等;灵活使用开放的BigTIFF文件格式,且可以无限制地安装免费MMI CellViewer软件,帮助研究人员用于各种实验目的。
CellScan的高灵活性:
MMI CellScan可与多种研究级显微镜兼容,以提供高度的灵活性。通过明场、多色荧光、共聚焦、相差等不同成像模式,来实现样本的全玻片扫描成像检测,获取高分辨率的大视野图像。
并且CellScan支持各种样本类型,包括传统的组织切片样本、活细胞样本,以及为激光显微切割设计的膜片样本等都可以兼容。这种高度的检测灵活性使得CellScan能够满足各种应用的不同需求,如数字病理学,细胞生物学和肿瘤学等。
5个维度的扫描成像:
CellScan具备以5D形式扫描全分辨率数字载玻片的能力,可以在XY方向上任意移动,在 Z-stack模式下检测有一定组织厚度的样本,通过延时成像捕捉随时间变化的动态图像,并可以实现多重荧光成像。
创新前沿的成像软件:
创新前沿的成像软件可以精确、轻松地增强整个载玻片成像体验。MMI分析软件附带无限许可证,并且图像载入格式为BigTIFF开放文件格式,可以促进大型团队内的远程和交互式工作。基于该软件可以进行图像采集和注释,通过导出和重新加载标记区域的功能,可以轻松标记和注释感兴趣的细胞和区域,再通过插入标尺,测量距离,就可以在MMI CellCut进行激光显微切割时使用该功能。另外,软件具有先进的拼接功能,可以确保单个图像完整拼接,边缘无任何重叠或伪影。
全玻片扫描与激光显微切割的结合:
很多领域的研究人员使用激光显微切割来选择性地分离单个细胞或组织,从而用于RNA测序等下游分析。但是在切割时,往往需要丢弃掉切片上较大的区域,从而丢失原始玻片中的宝贵信息。而MMI CellScan与CellCut激光显微切割系统相结合,可以对组织切片进行成像,然后精确选择细胞并解剖组织,同时保留有关原始未切割组织的信息和有关切割的位置信息。
将MMI CelScan与CelICut激光显微切割系统相结合的工作流程如下图所示:1.玻片扫描、2.确定目标区域、3.标记目标细胞、4.切取目标细胞、5.验证是否成功分离。
可扩展用于自动图像识别:
CellScan基于其模块化设计确保了整个MMI设备系列的兼容性和可升级性,CellScan具有多种模块,如用于精确激光显微切割的CellCut模块、用于分离悬浮细胞的CellEctor模块以及利用人工智能自动识别细胞和组织的 CellDetector模块,是一个灵活、适应性强的平台,可满足不断发展的研究的动态需求。通过MMI CellDetector可根据颜色差异或结构自动识别活体图像或扫描的整张玻片图像中的细胞或感兴趣的特定区域,如下图所示:
WSI应用方向
目前,WSI已广泛应用于病理学、肿瘤学和神经科学等各种研究领域,WSI能够创建可共享和长期保存的数字化玻片图像,从而改变工作流程和分析。
1、病理学诊断
传统上,病理学几乎完全依赖于安装在载玻片上的标本,但在等待载玻片或标本实际交付给相应的病理学家时,初始诊断通常会延迟,而WSI允许科学家扫描整张玻片,并使用机器学习(ML)、深度学习(DL)和人工智能(AI)工具进行诊断。WSI已获得美国食品和药物管理局的批准,用于美国病理学的初级诊断。
2、将表型与分子数据相关联
病理学家通常会审查组织切片中的肿瘤形态以对癌症进行分类和分级,而人工审查可能会导致低可重复性和不同观察者之间的分歧。WSI可以通过定量且可重复地大规模测量组织结构来部分克服这些不足。基于病理图像的大规模形态学分析可以将表型组与分子数据和临床结果相关联。
3、将表观遗传和形态学特征相关联
WSI可以用来研究癌症与DNA甲基化之间的相互作用,以提供对肿瘤病理生物学更好的理解。经典的机器学习算法将癌症样本的DNA甲基化过程与从整个载玻片图像中提取的形态测量特征相关联。
4、绘制脑组织中的多色荧光标记物
WSI可以用于筛查整个脑组织中罕见的生理相关事件,例如使用传统显微镜可能会漏检的微出血事件。通过将大的脑组织切片贴到大型载玻片上,并对多个荧光通道进行成像,从而扩展数字病理学图像分析在神经科学领域的应用。
5、简化显微切割流程
基于下一代测序和蛋白质组学的分子诊断分析需要改进从组织切片获取靶细胞的方法,激光显微切割可以在可视化下成功地从组织标本中分离出不同的细胞,用于各种研究和临床应用。那些需要对多个细胞进行分子分析或评估大量样本的大型项目可能令人望而生畏,而WSI与显微切割相结合,简化了这些过程,有可能加快临床和生命科学显微切割工作。
6、药物开发
由于定量图像分析可提供有价值的多参数输出结果,因此,可以基于数字病理学技术通过定量图像分析的方法进行组织的生物标记物发现研究。结合组织芯片,WSI 使研究人员能够同时比较所有标本中的潜在生物标记物。
德国Molecular Machine & Industries (MMI)是专门致力于将显微操作技术与高精度激光技术相结合应用于生命科学领域的一家专业公司,其标志性产品MMI CellCut激光显微切割系统、CellEctor单细胞分选系统以及CellScan全玻片扫描系统成为目前世界上性能优异的样本处理系统。基因有限公司作为MMI产品中国区合作伙伴,可为感兴趣的客户提供专业的产品咨询、技术答疑及联系试用等。
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