【NEB上新啦!】高灵敏度病毒核酸检测的绝佳选择

Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒

【字体: 时间:2024年08月21日 来源:基因有限公司

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  Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提供快速可靠的磁珠法提取流程,用于从唾液和呼吸道拭子样本中提取病毒核酸。

Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提供快速可靠的磁珠法提取流程,用于从唾液和呼吸道拭子样本中提取病毒核酸。

该试剂盒兼具硅胶膜法核酸纯化的高效性和磁珠法的易用性。手动和自动实验流程支持在微量离心管或96孔板中处理样本。试剂盒规格兼容96孔板包装形式(100/600/1800次反应)并且操作流程兼容多种仪器平台(包括KingFisher Flex磁性微粒处理器以及Agilent Bravo和MGISP液体处理器)的高通量自动化流程。

产品特点

1 设计用于免手动操作提取病毒DNA和/或RNA。

2 利用磁珠法,兼容手动操作以及多种仪器平台(KingFisher®Flex、Agilent®Bravo®、MGISP®液体处理器等)的高通量自动化实验流程。

3 针对唾液和呼吸道拭子样本类型进行了测试;兼容经过富集操作(不提供)的废水样本。

4 适用于qPCR/RT-qPCR、ddPCR、测序/NGS文库制备等下游应用。

5 包含载体RNA (carrier RNA),适用于在基于RNA的扩增实验流程中进行高灵敏度检测。

实验流程

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使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒进行磁珠法手动或自动纯化病毒核酸的实验流程概览

实验性能数据

1. 与其它供应商试剂盒相比,Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒具有高重复性和高灵敏度。

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用保存在VTM(Hardy Diagnostics®)中经热灭活处理的SARS-CoV-2(ATCC)制备低病毒载量的模拟样本。

使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒和其它两家供应商的类似试剂盒进行核酸提取。使用NEB #E3019 和BioRad CFX96 Touch实时PCR检测系统进行RT-qPCR检测。

与测试的其它厂家试剂盒相比,即使病毒载量较低时,Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒也始终表现出较低的Ct值和可重复性数据。

2. 对使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取的RNA进行RT-qPCR检测,证明可从同一样本中检测多种病毒。

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使用重悬于VTM(Hardy Diagnostics®)中的灭活流感病毒和SARS-CoV-2病毒(Microbiologics®)的拭子样本,制备包含高病毒载量和低病毒载量样本的模拟共感染样本。使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒按照KingFisher®自动化操作流程进行核酸提取。使用相关引物探针和Bio-Rad® CFX96 Touch™实时PCR检测系统进行RT-qPCR检测。Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒可以成功从同一样本的多种病毒中提取核酸。

3. 使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒从废水样本中提取核酸,实现完整的SARS-CoV-2基因组覆盖度

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用基因组浏览器(IGV)观察整个SARS-CoV-2基因组的read覆盖度(对数刻度)。使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒从掺入75 万份灭活SARS-CoV-2病毒微粒(ATCC® 1986HK)的RNA提取裂解液或废水样本中提取RNA。在提取RNA之前,使用Nanotrap® Microbiome A微粒对人工废水样本进行病毒微粒富集。将2万份Twist Bioscience Synthetic SARS-CoV-2 RNA Control 23模板作为扩增子生成和文库制备的阳性对照。使用NEBNext® VarSkip Short v2 SARS-CoV-2 primer pool 和NEBNext ARTIC SARS-CoV-2 FS文库制备试剂盒-含片段化酶(Illumina)进行扩增子和文库制备。使用NextSeq® 500/550仪器(2x75bp)对文库测序。确定每个碱基的覆盖深度,使用seqtk抽取read,再使用Bowtie2将其与SARS-CoV-2参考基因组(NCBI,NC_045512)进行比对。

4. 对使用Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒提取的DNA进行qRT-PCR检测,表现出对靶标DNA病毒的准确检测和定量。

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Monarch®磁珠法病毒DNA/RNA提取试剂盒用于提取DNA,样本是两种不同病毒载量的i.人类腺病毒3型(ZeptoMetrix)和ii.巨细胞病毒(ZeptoMetrix),使用 KingFisher自动化操作流程。将洗脱后的DNA在Bio-Rad® CFX96 Touch™实时PCR检测系统上进行qRT-PCR检测。各病毒载量的扩增曲线检测信号与预期相符,表明成功提取了病毒DNA。

产品信息

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