基因组学还有更多要揭示的东西

oncotarget上的一篇题为“基因组学有更多的启示”的社论，回顾了分子和细胞遗传学分析在急性髓性白血病研究的一些进展。

　　

一篇新的社论发表在Oncotarget的第15卷上，题为“基因组学有更多的启示”。来自里尔大学的研究人员 Laurène Fenwarth和Nicolas Duployez在这篇新的评论中讨论了分子和细胞遗传学分析应用于识别突变和结构变异，定义急性髓性白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)的不同亚型的进展。这些遗传因素已成为风险分层和选择适当治疗（包括异体造血干细胞移植的使用）的必要因素。

作者指出，尽管自从急性髓性白血病(AML)基因组首次发表以来已经进行了超过15年的基因组研究、以及癌症基因组图谱(TCGA)等大型研究，但根据目前的知识，仍有大约15%的急性髓性白血病(AML)病例在遗传上无法分类。

值得注意的是，几项针对成人和儿童的研究发现，(AML)的一个亚群没有已知的起始事件，但特别富集FLT3-ITD和WT1突变，以及总体预后不良的正常核型。在2021-2022年，特别是由于生物信息学方法和工具的进步，在高危儿童AML病例中发现了部分UBTF基因的复发性体细胞串联重复(TD)。随着回顾性队列筛查的增加，与这种分子改变相关的特征已经得到证实。UBTF-TD被认为是白血病发生的起始事件，并定义了髓系恶性肿瘤的一个独特群体。

据估计，UBTF-TD影响4%的儿科AML病例(9%的儿科AML复发病例)，3%的年轻成人AML病例(18-60岁)，60岁以后的病例不到0.5%。这些研究也证明了骨髓增生异常综合征(MDS)的密切连续性。对无遗传易感的儿童骨髓增生异常综合征(MDS)病例的研究发现，UBTF-TD突变的频率约为30%。UBTF-TD与其他遗传性病变的特定模式相关，包括WT1突变(~ 50%)，FLT3-ITD(~ 50%)和8染色体三体(~ 30%，而~ 60%的病例具有正常核型)，并且与其他类别定义病变(即NPM1或cebpa - bzip突变和复发性融合)相互排斥。MDS/AML合并UBTF-TD的预后总体较差，通常为年轻患者群体。大多数可用的数据来自于AML病例，与UBTF野生型患者相比，接受强化化疗±异基因造血干细胞移植治疗的AML病例显示更高的诱导失败率和复发率，并且在评估时，治疗后的最小残留病(MRD)率更高。这些以前在基因上无法分类的病例的认识，为在常规实践中发现它们和开发新的治疗策略铺平了道路。特别是，转录研究表明HOXA/HOXB簇基因和MEIS1的高表达，这一特征也在NPM1突变的AML中发现，表明对menin抑制剂敏感。最近的一项研究证实了UBTF-TD在原发性AML细胞中的这种敏感性，考虑到这种改变与FLT3-ITD的强烈关联，与FLT3抑制剂的联合治疗还需要进一步评估。