武汉病毒所袁志明、夏菡/耶鲁大学合作绘制埃及伊蚊中肠单细胞图谱

【字体: 时间:2024年06月07日 来源:中国科学院武汉病毒研究所

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  2024年6月6日,武汉病毒所袁志明、夏菡与耶鲁大学医学院崔颖俊合作在国际学术期刊Scientific Data在线发表了题为“A cell atlas of the adult female Aedes?aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing”(《埃及伊蚊雌性成蚊中肠单细胞转录组图谱》)的论文

  

伊蚊是登革病毒、黄热病毒、基孔肯亚病毒等多种病毒的重要传播媒介。蚊虫中肠既是其消化血餐和吸收营养的器官,还是病毒感染蚊虫并复制增殖的初始靶器官,在蚊虫传播病毒和防御病毒中起双重作用,是研究蚊虫-病毒相互作用的重要模型。蚊虫传播病毒的关键因素之一是中肠细胞对病毒的易感性,而中肠细胞的异质性会影响病毒的感染和复制,因此在单细胞水平研究蚊虫感染传播病毒的特征具有重要意义。但是目前针对埃及伊蚊仍缺乏可用的中肠单细胞转录组图谱。

2024年6月6日,武汉病毒所袁志明、夏菡与耶鲁大学医学院崔颖俊合作在国际学术期刊Scientific Data在线发表了题为“A cell atlas of the adult female Aedes?aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing”(《埃及伊蚊雌性成蚊中肠单细胞转录组图谱》)的论文。

该研究选择仅喂食葡萄糖水的7日龄成年雌性埃及伊蚊,解剖并收集其中肠,通过酶解离和密度梯度离心等方案制备成单细胞悬液并使用10x Genomics平台进行单细胞转录组测序(图1),绘制了埃及伊蚊中肠单细胞图谱。通过对单细胞的转录组特征进行聚类注释得到肠干细胞/肠母细胞(ISC/EB)、贲门细胞(Cardia)、肠上皮细胞(EC)、类肠上皮细胞(EC-like)、肠内分泌细胞(EE)和内脏肌细胞(VM) 等六类肠道细胞(图2)。此外,还明确了不同类型细胞的标记基因(图2)。本研究将为进一步在单细胞水平上解析蚊虫感染和传播病毒规律的研究奠定基础。

武汉病毒所博士研究生汪顺龙和博士后黄英为论文第一作者,袁志明研究员、夏菡青年研究员和耶鲁大学医学院崔颖俊副研究员为论文的通讯作者,海南大学教授韩谦为合作作者。该研究得到国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助。

图1.埃及伊蚊中肠单细胞转录组分析流程。

图2.埃及伊蚊中肠单细胞聚类与注释。(a)不同类型中肠细胞的聚类;(b)不同类型中肠细胞数量占比;(c)不同类群中肠细胞的标记基因。


文章链接:https://www.nature.com/articles/s41597-024-03432-8


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