动物研究所科学数据中心合作在《Journal of Extracellular Vesicles》发表数据论文

　　

近期，动物研究所科学数据中心林聪田博士与中国科学院城市环境研究所黄乾生研究员团队发挥各自数据优势，开展多学科数据交叉合作，共建“细胞外囊泡数据库”，相关数据论文成果以《EV-COMM: A database of interspecies and intercellular interactions mediated by extracellular vesicles》为题在细胞外囊泡权威期刊《Journal of Extracellular Vesicles》（IF=16）发表。科学数据中心林聪田博士为本文共同通讯作者。细胞外囊泡（Extracellular vesicles,EVs）是由生物体分泌的纳米级颗粒，通过携带、传递RNA、蛋白质和代谢产物等功能分子，介导环境与生物体、以及生物体之间的互作，成为广受关注的信号通讯载体。已有EVs数据库关注EVs中的功能分子，但没有纳入互作的物种信息，缺乏EVs介导的完整互作知识链条数据，无法满足领域的数据需求。本研究利用《环境健康主题数据库》在环境胁迫数据、胞外囊泡数据方面的积累和《中国动物主题数据库》在物种信息、物种合作方面的数据积累，双方紧密合作，开发了“细胞外囊泡数据库”，收集、整合和展示了细胞外囊泡介导的1400多条相互作用事件，涵盖蛋白质，脂质，DNA，RNA四种功能分子，213种生物体，46种组织/器官。科学数据中心团队主要负责数据库设计、物种数据关联和服务平台开发。

论文链接：https://isevjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jev2.12442

EVs介导的物种互作示意图