张铁军教授课题组发现血浆代谢组特征可预测远期肝硬化并发症

【字体: 时间:2024年05月01日 来源:复旦大学公共卫生学院

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   近日,我院张铁军课题组与人类表型组研究院陈兴栋团队的合作研究以“Machine learning-based plasma metabolomic profiles for predicting long-term complications of cirrhosis”为题发表于美国肝病学会(AASLD)会刊《Hepatology》

  

近日,我院张铁军课题组与人类表型组研究院陈兴栋团队的合作研究以“Machine learning-based plasma metabolomic profiles for predicting long-term complications of cirrhosis”为题发表于美国肝病学会(AASLD)会刊《Hepatology》。

据全球疾病负担研究估计,每年可归因于慢性肝病的死亡数超过100万,其中大多数死亡继发于肝硬化并发症。当前,慢性肝病的临床关注点主要集中于肝硬化及其并发症阶段,而早期可逆性的疾病阶段往往被忽略,从而导致患者错过最佳干预时期。因此,运用有效的非侵入性手段促进慢性肝病高危人群的早期识别与风险分层是实现肝硬化并发症精准预防的关键。

张铁军课题组构建了基于梯度提升算法的代谢状态模型(图1)并与基因风险评分及传统临床评分等进行比较;同时整合代谢状态、人口统计学变量以及实验室检测变量,以构建易于解释的列线图模型,并基于双截断值法实现肝硬化并发症的人群风险分层。模型的预测能力于验证队列中进行独立评估。

图1 可解释框架下的代谢状态模型及其性能

研究发现,脂质代谢物及铁死亡相关代谢物能够精准预测肝硬化并发症的发病风险。其中,代谢状态模型可以准确地预测10年肝硬化并发症的发生风险,模型的曲线下面积(AUC)为0.84,优于基因风险评分(AUC差值0.25)与FIB-4评分(AUC差值0.06)。整合代谢状态的列线图模型在验证队列中的3年AUC为0.930,5年AUC为0.889,10年AUC为0.861。风险分层后高危组人群与低危组人群的风险比为43.58(95% CI 27.08-70.12)(图2)。

图2 列线图模型风险分层后的表现

本研究对于促进肝纤维化早期逆转及肝硬化的药物开发、精准防治有着重要意义。基于血浆代谢组学和机器学习所建立的模型,不仅可用于精准识别处于沉默进展期的肝硬化并发症高危患者,同时也提示了肝纤维化早期的代谢通路改变及可用于精准干预的潜在药物靶点。

上海市重大传染病和生物安全研究院博士生郭城楠与人类表型组研究院刘振球青年研究员为论文的共同第一作者,张铁军教授与陈兴栋研究员为该论文的共同通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金(82204125; 81772170),国家重点研发计划项目(No. 2022YFC3400700)以及科技基础研究专项基金(2019FY101103)的资助。

我院张铁军教授与人类表型组研究院陈兴栋/刘振球课题组长期合作致力于慢性肝脏疾病的分子与遗传流行病学研究,近年来在Gut、Journal of Hepatology、Hepatology、Clinical Gastroenterology and Hepatology、Metabolism、BMC Medicine、International Journal of Epidemiology、International Journal of Cancer等权威期刊连续发表多篇肝病相关研究成果。

 

文章链接:

https://journals.lww.com/hep/abstract/9900/machine_learning_based_plasma_metabolomic_profiles.850.aspx

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