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新的工具揭示了基因如何工作和细胞如何组织
【字体: 大 中 小 】 时间:2024年04月09日 来源:AAAS
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来自奥胡斯大学和意大利理工学院的研究人员发现了某些蛋白质是如何附着在RNA中的特殊结构上的,这种结构被称为g -四联体。此外,他们还开发了能够预测这些蛋白质- rna相互作用的计算工具。预测这些相互作用的新发现的能力可以帮助未来的工作理解细胞中的分子途径,并为开发针对这些RNA g -四重体结合蛋白的药物铺平道路,这些蛋白质被发现与癌症等疾病有关。
与RNA结合的蛋白质在细胞的许多过程中都是重要的,并且可以介导一系列的生物功能。DNA和RNA中的一种特殊结构,G-四联体(G-quadruplex),是参与DNA和RNA基因表达的调控元件。在目前的工作中,研究人员使用理论预测和分子生物学实验来证明许多染色质结合蛋白与RNA G-四联体结合。有了这些信息,他们可以根据蛋白质结合RNA g -四联体的潜力对蛋白质进行分类。
该研究结合了RNA G-四联体结合蛋白的实验鉴定和计算方法,建立了一个预测工具,以确定蛋白质与RNA G-四联体结合的概率。研究结果表明,预测的蛋白质表现出高度的蛋白质紊乱和亲水性,表明参与转录和相分离到无膜细胞器。
研究小组先前已经表明,RNA-DNA双结合蛋白可能参与DNA损伤反应,将DNA和RNA的结合特性与许多蛋白质联系起来。在这项新研究中,研究人员扩展了RNA结合蛋白的知识,以鉴定RNA G-四联体结合蛋白。
研究人员还开发了一种计算工具来评估蛋白质的RNA G-四联体结合潜力,这些蛋白质可以在http://service.tartaglialab.com/new_submission/clever_G4_classifier上访问。
有了这些新的结果,研究人员确定了蛋白质-RNA相互作用的特性,并提供了识别G-四联体结合特性的方法,这些特性可能会成为疾病的靶向治疗方法。
研究结果刚刚发表在《自然通讯》杂志上。