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蛋白质片段识别出两种新的“极端微生物”,可能有助于寻找外星生命
【字体: 大 中 小 】 时间:2024年03月19日 来源:AAAS
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完美适应的微生物生活在从深海战壕到山顶的极端环境中。了解更多关于这些极端微生物如何在恶劣条件下生存的信息,可以让科学家了解地球上的生命和其他星球上潜在的生命。在ACS的蛋白质组研究杂志上,研究人员详细介绍了一种基于蛋白质片段而不是遗传物质的更准确的极端微生物鉴定方法。这项研究从智利的高海拔湖泊中发现了两种新的耐寒细菌,那里的环境类似于早期的火星。
完美适应的微生物生活在从深海战壕到山顶的极端环境中。了解更多关于这些极端微生物如何在恶劣条件下生存的信息,可以让科学家了解地球上的生命和其他星球上潜在的生命。在美国化学学会的《蛋白质组学研究杂志》上,研究人员详细介绍了一种基于蛋白质片段而不是遗传物质的更准确的极端微生物鉴定方法。这项研究从智利的高海拔湖泊中发现了两种新的耐寒细菌,那里的环境类似于早期的火星。
尽管人类倾向于避免在极热、极冷或高海拔地区定居,但一些微生物已经适应了在这些恶劣的地方生活。这些极端微生物引起了在其他行星上寻找生命的天体生物学家的兴趣。研究人员目前使用个体基因测序来识别地球上的微生物,基于它们的DNA。然而,目前的方法不能区分近亲的极端微生物物种。因此,拉尔夫·莫勒和他的同事们研究了他们是否可以通过蛋白质特征而不是基因序列来识别极端微生物。
研究人员从智利Altiplano海拔超过2.3英里的五个高海拔安第斯湖泊的水样开始了他们的演示。(作为参考,丹佛海拔约1英里)。从样本中,研究人员培养了66种微生物,然后决定两种方法中哪一种能更好地识别微生物:
传统的基因测序将来自每个样本的16s rRNA基因(基于序列的微生物分析的典型基因)的核苷酸与数据库进行比较以进行鉴定。
较新的“蛋白质分型”技术分析了被称为肽的蛋白质片段,以产生肽特征,该团队利用肽特征从蛋白质组数据库中识别微生物。
通过这些方法,研究人员鉴定了从高海拔湖泊样本中培养的66种微生物中的63种。对于基因测序未能确定的三种微生物,因为它们的遗传信息不在可用的数据库中,蛋白质分型确定了两种潜在的新类型的嗜极细菌。这些结果表明,蛋白质分型可能是从小生物样本中鉴定极端微生物的更完整的解决方案。该团队表示,蛋白质分析有朝一日可以帮助我们寻找和识别外星生命,并更好地探索我们自己星球上的生物多样性。