吸烟对肺部组织的甲基化有何影响?

【字体: 时间:2024年03月18日 来源:AAAS

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  芝加哥大学领导的研究团队近日分析了9种人体组织的数据,以了解吸烟的细胞和基因损伤有多大。他们在肺部和结肠组织中发现了与吸烟有关的表观遗传变化。

  

众所周知,吸烟对健康极为有害。烟草的烟雾中含有数千种化学物质,包括致癌物质,会增加癌症、心血管疾病和呼吸系统疾病的风险。

芝加哥大学领导的研究团队近日分析了9种人体组织的数据,以了解吸烟的细胞和基因损伤有多大。他们在肺部和结肠组织中发现了与吸烟有关的表观遗传变化,并探索了这些变化的预期基因调控和表达后果。

这篇题为“The association of cigarette smoking with DNA methylation and gene expression in human tissue samples”的论文于3月14日发表在《美国人类遗传学杂志》上。

之前的研究发现,吸烟对健康造成的影响在部分程度上是通过表观遗传变化实现的。不过,这些研究主要是用血液样本进行的。因此,研究人员推断,利用全基因组DNA甲基化分析对更多样本进行分析,可能会发现吸烟对DNA甲基化的其他影响。

通讯作者、芝加哥大学公共卫生科学系的Brandon Pierce表示:“如果我们想了解吸烟等环境暴露的影响,除了血液之外,研究各种组织类型也很重要,因为疾病是发生在体内的各个不同器官。”

利用GTEx项目收集的916份组织样本,研究人员鉴定了人体九种组织内CpG位点上的胞嘧啶甲基化,包括肌肉、肺部、血液、肾脏、乳腺、前列腺、卵巢、睾丸和结肠。组织样本还附带了供者是否吸烟的数据,将其分为从不吸烟者、曾经吸烟者和现在吸烟者。

他们发现了数千个与吸烟相关的甲基化标记,这些标记主要集中在肺部和结肠这两种组织类型中。全基因组甲基化分析并未发现其他组织类型与吸烟有显著关联。

在212个肺部组织样本中,研究团队发现了6350个与吸烟相关的胞嘧啶甲基化转变,其中许多甲基化水平低于正常。在210个结肠组织样本中,他们发现了2735个与吸烟相关的甲基化变化。在1646个位点(肺部)和22个位点(结肠),吸烟与DNA甲基化和局部基因表达均有关联。

研究人员解释说,尽管少数位点同时出现在肺部和结肠组织中,但所涉及到的特定CpG甲基化位点在每种组织类型中似乎是不同的,这有助于人们了解组织中受到吸烟影响的基因。

他们接下来对肺部组织中发现的与吸烟相关的DNA甲基化变化进行通路分析,发现细胞凋亡、外源代谢、紫外线辐射反应、癌症相关信号通路等受到了影响。

Pierce表示,除了吸烟,他还想用同样的技术来了解其他不太明显的环境暴露。“我们可以找出表观遗传特征,作为暴露影响的生物标志物。例如,根据一个人的表观基因组,我们就能判断他是否接触过特定类型的污染物。组织越多样化,样本量越大,我们的信息就越多。”


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