单细胞RNA-seq揭示活化蛋白C对阿尔茨海默病的转录组调节

一篇新的研究论文发表在inAging杂志上，题为“单细胞RNA-seq揭示了激活蛋白c对阿尔茨海默病的转录组调节”。

　　

一篇新的研究论文发表在Aging (MEDLINE/PubMed列出的“Aging (Albany NY)”和Web of Science列出的“Aging- us”)第16卷第4期，题为“单细胞RNA-seq揭示了活化蛋白c对阿尔茨海默病的转录组调节”。

单细胞RNA测序揭示了阿尔茨海默病(AD)模型5xFAD (5x家族性AD突变)与野生型(WT)小鼠细胞群的变化。在这项新的研究中，来自南佛罗里达大学、密西西比大学医学中心和G.V. (Sonny) Montgomery VA医学中心的研究人员Mohammad Kasim Fatmi、Wang Hao、Lily Slotabec、Changhong Wen、Blaise Seale、Bi Zhao和Ji Li使用单细胞RNA测序和生物信息学分析分析了APC [Activated Protein C]治疗对AD转基因小鼠的影响。

“在我们的研究中，我们使用了含有五种主要淀粉样蛋白病理表达的转基因小鼠，这些淀粉样蛋白病理允许AD和Aβ沉积的快速进展，被称为5xFAD小鼠。”

返回的测序数据通过10x Genomics CellRanger平台进行比对，形成相应的矩阵进行生物信息学分析。与WT相比，5xFAD的神经胶质细胞发生了改变，尤其是小胶质细胞的增殖在5xFAD中明显增加。5xFAD与WT的胶质细胞差异表达检测揭示了基因调控。在全球范围内，与AD进展相关的关键基因如Apoe、Ctsb、Trem2和Tyrobp上调。

利用这些差异表达数据，我们完成了氧化石墨烯项富集，以观察AD进展可能影响的生物学过程。利用抗炎和细胞保护重组活化蛋白C (APC)，研究人员发现，除了恢复神经系统过程外，APC治疗还下调了炎症过程。此外，动物研究表明，重组APC可显著减轻5xFAD小鼠的Aβ负荷，改善其认知功能。

“在5xFAD中，高表达的AD生物标志物的下调可以为APC治疗对AD有益的机制提供见解。”