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一款便捷高效的DNA纯化分选磁珠
【字体: 大 中 小 】 时间:2024年12月09日 来源:Takara
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Takara推出了DNA纯化分选磁珠产品MagBEST DNA Select and Clean-up。回收率高,产物纯度好,可从PCR等酶反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等,直接应用于PCR、连接、NGS建库等下游实验。
磁珠是NGS建库过程中不可或缺的产品之一。
Takara推出了DNA纯化分选磁珠新产品MagBEST DNA Select and Clean-up(TCH051&TCH049&TCH050)。它的表面经过化学基团修饰超顺磁性磁珠,可以使核酸分子在一定条件下结合到磁珠表面。基于固相可逆固定技术(SPRI),在外加磁场作用下,使结合了核酸的磁珠与溶液中的其他杂质分离,再通过清洗,洗脱等步骤,达到纯化核酸的目的。
先让我们来了解一下它吧!
产品特点
可从PCR等酶反应液中回收不同片段大小的DNA,有效去除酶、dNTP、盐类等
回收率高,产物纯度好,可以直接应用于PCR、连接、NGS建库等下游实验
应用于NGS建库时,操作方法、试剂用量以及建库质量与主流产品一致
可配合全自动核酸提取仪进行全自动、高通量的核酸提取
实验例1 PCR产物纯化结果比较
MagBEST DNA Select and Clean-up纯化的PCR产物回收率高,纯度好。
· PCR试剂:R060 Tks Gflex™ DNA Polymerase
· PCR产物:Beads(体积比)=1:1.8
◆ 纯度
◆ 回收率
(Takara Biomedical Tech. Co., Ltd比较结果)
实验例2 DNA片段分选
不同加量时,Takara MagBEST产物的Agilent分析仪检测的电泳形态和平均分子量与A公司同类产品和N公司同类产品相当。
(Takara Biomedical Tech. Co., Ltd比较结果)
实验例3 NGS应用
以1 ng 小鼠脑Total RNA样本为起始模板,使用SMARTer Stranded RNA-Seq Kit构建RNA-Seq文库,分别用Takara MagBEST和A产品对文库进行纯化,并使用Agilent2100 Bioanalyzer进行分析。然后使用NovaSeq X(PE 150)测序,并将Reads downsampled至5M reads。之后使用Hisat2的Ensembl注释mapping到小鼠 [GRCm38] 基因组,并使用Qualimap分析mapping结果。
◆ 文库质控
结果显示,使用Takara MagBEST制备的RNA-Seq文库产量和片段大小与A公司同类产品相当。
(Takara Biomedical Tech. Co., Ltd比较结果)
◆ 测序质量&Mapping质量
使用Takara MagBEST制备的RNA-Seq文库测序质量和mapping质量与A公司同类产品相当。
(Takara Biomedical Tech. Co., Ltd比较结果)
■ 产品列表
Code No. 制品名称 包装量
TCH051 MagBEST DNA Select and Clean-up 1 ml
TCH049 MagBEST DNA Select and Clean-up 5 ml
TCH050 MagBEST DNA Select and Clean-up 5ml x 6