王晓群/何顺民研究组合作构建人类和非人灵长类大脑多组学时空数据库MAPb...

　　

　　伴随着对脑发育研究的深入，促进个体在不同生命阶段实现健康的脑发育与认知发展，已成为全球科学家关注的重要问题。近年来，随着神经发育相关研究成果的不断涌现以及单细胞测序、空间转录组学技术以及单细胞表观遗传组学技术等高通量技术的快速发展，大量与脑发育相关的多组学数据层出不穷。然而，目前仍然缺乏一个综合性的整合脑发育生物学多组学数据的专门数据资源库，限制了研究人员从多维度全面揭示脑发育过程及其影响因素的能力。

　　2024年10月18日，中国科学院生物物理研究所王晓群研究组、何顺民研究组，北京师范大学吴倩研究组联合在《Nucleic Acids Research》杂志发表论文"MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain"。研究团队从单细胞转录组、空间转录组、表观遗传组等不同层面整合了脑发育相关数据集，构建了一个人类和非人灵长类大脑多组学时空图谱数据库--MAPbraina, Multi-omics Atlas of the Primate brain，首次实现了聚焦于灵长类脑发育多组学数据的收录和整合，揭示了基因表达调控随脑发育成熟的时空动态变化。(http://bigdata.ibp.ac.cn/mapBRAIN/)

　　该数据库整合了来自人类和五种非人灵长类动物的三类组学数据，涵盖了6个物种，收集了2100多万个细胞，并鉴定了161种细胞类型，覆盖灵长类大脑的38个脑区和436个亚区，跨越了164个不同的发育时间点。用户可以通过该数据库实现对所收录数据的交互式访问，并能够在跨物种、跨脑区及跨发育阶段进行数据比较。同时，MAPbrain支持用户对转录组学和表观遗传组学数据的联动搜索和比较。此外，数据库还提供了1,078,709个与不同发育阶段相关的特异性基因表达集，帮助用户更深入理解特定基因在发育生物学中的功能和作用。作为一个持续更新的开放数据共享平台，MAPbrain为用户提供了搜索和获取现有数据的便利。为了进一步服务用户，MAPbrain还开发了CellMapping功能，支持用户将其数据与数据库进行整合，帮助预测细胞类型等信息，并实时反馈给用户，真正实现数据的整合和应用，支持脑发育相关大数据的开放和共享，并推动前沿交叉研究和转化应用的开展。

　　综上所述，该数据库构建了一个多组学人类以及非人灵长类大脑时空细胞图谱，揭示了大脑发育过程中细胞类型、基因表达、染色质可及性的动态变化，并开发了交互式网页以供用户探索和应用。MAPbrain期待在广大科学研究人员的积极参与下，持续收集更多高质量的脑发育研究数据，从而更有效地推动神经发育生物学领域的发展。

　　中国科学院生物物理研究所王晓群研究员、何顺民研究员和北京师范大学吴倩教授为该论文的共同通讯作者。生物物理研究所博士研究生卓良辰，博士研究生王梦迪和副研究员宋廷瑞为该论文的共同第一作者。该研究得到国家自然科学基金、科技创新2030项目、中国科学院、新基石科学实验室等经费的支持。

　　文章链接：https://doi.org/10.1093/nar/gkae911

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（供稿：王晓群研究组、何顺民研究组）

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