细菌感染的新诊断方法

对于细菌感染的患者，越早接受适当的抗生素治疗，他们的病情就越好。目前确定哪种药物可能对每个病人有效的方法依赖于在实验室中培养病人身上的细菌，需要几天的时间才能得出结果。与此同时，患者经常被给予广谱抗生素，这鼓励了耐药感染，这是一个重大的公共卫生威胁。

　　

麻省理工学院、哈佛大学和麻省总医院的研究人员开发了一种创新的诊断方法，有朝一日可以帮助患者更快地获得最有效的治疗，从而减少对广谱抗菌药物的需求。这种方法被称为通过RNA检测的基因型和表型抗生素敏感性测试（GoPhAST-R），通过分析细菌的生长和遗传活性来快速确定病原体对各种药物的敏感性。现在，研究人员已经在一项对接受感染住院治疗的患者进行血液培养的初步研究中证明了这种方法的潜力。

研究结果发表在《Journal of Clinical Microbiology》上。

这项研究的资深作者Roby Bhattacharyya说：“通过这项研究，我们朝着我们更大的目标又迈出了一步，那就是帮助人们更快地做出诊断，这样病人就能更快地康复。”Roby Bhattacharyya是麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的副成员，哈佛医学院的助理教授，也是马萨诸塞州总医院（MGH）医学部传染病科的主治医生。

GoPhAST-R的试驾

在GoPhAST-R方法中，研究人员将细菌样品暴露于各种抗生素中，然后使用RNA检测平台寻找信使RNA表达的不同变化模式，这反映了细菌基因活性的差异。这些mRNA的变化在对药物敏感的细菌接触抗生素几分钟后就会出现，但在耐药的细菌中不会出现。此外，该方法还检查了已知构成抗生素耐药性的基因，这可以为潜在的细菌机制提供线索，并指出潜在的治疗方案。

在之前对来自MGH临床微生物实验室的少量患者样本的研究中，研究小组表明，GoPhAST-R可以在血液培养中检测到细菌后不到4小时内确定抗生素敏感性，而使用标准临床实验室方法则需要28-40小时。

在这项新的研究中，他们扩大了临床试验的范围，纳入了42名因感染大肠杆菌或肺炎克雷伯菌而住院的患者的血液样本，这两种细菌是血液感染中最常见的病原体。研究人员将血液培养物暴露于三种不同抗生素类别的九种不同药物中，然后在NanoString平台上进行转录分析。他们检查了每一类抗生素的10个基因的mRNA变化，以及少数对-内酰胺类药物产生耐药性的基因。

他们的结果与抗生素敏感性的金标准生长试验的结果达到了95%的一致性。Bhattacharyya说：“在这个试验中，我们已经证明了GoPhAST-R是一种可以在临床中很好地发挥作用的方法。下一步将是展示GoPhAST-R在实时制定患者护理决策方面的实用性。我们希望有一天能看到它成为一种可以在各地医院使用的检测方法，帮助患者在不促进耐药性的情况下获得更有效的治疗。”

Bhattacharyya感谢MGH临床微生物实验室的参与，以及医院患者的贡献，使这项研究成为可能。“没有它们，我们绝对无法取得这些发现。”