Cell Genomics：根据肿瘤微环境特征来预测甲状腺癌的预后

　　

大多数甲状腺恶性病变都属于“懒癌”，可通过手术切除甲状腺，再使用放射性碘来成功治疗。然而，少数患者可能在几十年后复发，进展为甲状腺未分化癌（ATC）。这是目前最致命的癌症之一，患者的中位生存期仅为3-5个月。因此迫切需要了解甲状腺癌进展的驱动因素。

范德比尔特大学医学中心领导的研究团队通过多组学分析发现了甲状腺癌样本的免疫及其他微环境特点，并总结出甲状腺癌的侵袭性特征。这项成果于近日发表在《Cell Genomics》杂志上。

研究人员解释说，过去的甲状腺癌分析主要集中在与恶性程度和肿瘤进展有关的特征上。在此项研究中，他们综合了基质微环境、肿瘤基因突变、基因融合等特征，以评估对甲状腺癌侵袭性、治疗应答、疾病复发和患者预后有贡献的潜在因素。

通讯作者、范德比尔特大学病理学、微生物学和免疫学系助理教授Vivian Weiss表示：“分子检测是甲状腺癌研究领域的一大重点。目前的一个关键问题是基因表达数据是否能成为高风险突变（如TP53）的补充，从而预测哪些肿瘤可能复发、转移或对治疗产生耐药性。”

研究人员综合采用肿瘤外显子组测序、RNA测序和空间转录组分析等技术，在251名甲状腺癌患者的312个FFPE切除病灶中寻找预后标志物。他们指出，此次检测的肿瘤样本包括116个乳头状亚型样本、106个滤泡状亚型样本、55个转化亚型样本以及35个非肿瘤性样本。

通过这些数据，研究人员提出了一个由549个基因组成的“分子侵袭和预测（MAP）”评分，根据肿瘤微环境的信息来预测甲状腺癌的侵袭性。这组基因既包括肿瘤微环境的成分，比如免疫浸润、胶原重塑和癌症相关成纤维细胞基因，也包括上皮细胞去分化和细胞分裂等通路中的基因。

“MAP评分覆盖了与肿瘤微环境中的关键细胞群相关的基因，突出了成纤维细胞和巨噬细胞在甲状腺疾病进展和耐药性中的重要性，” Weiss解释说。

当研究人员将MAP评分法应用于甲状腺未分化癌时，他们发现属于MAP中等评分组的肿瘤往往对免疫检查点疗法有着相对较强的应答。相比之下，MAP评分较高的肿瘤对免疫疗法的应答较差，总体风险较高。

作者报告称：“我们的研究表明，将包括基质基因在内的分子特征与标准的突变分析相结合，可以改善甲状腺癌患者的风险分层，甚至预测甲状腺未分化癌患者的免疫治疗应答。未来，我们想建立一个检测平台，利用突变数据和基质微环境数据来预测结局和治疗应答。”

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