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干货分享丨化繁为简,如何让PCR更省时高效?
【字体: 大 中 小 】 时间:2023年09月15日 来源:网络
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直接PCR(Direct PCR)是一种无需经过核酸提取,可直接使用动物或植物组织等材料直接进行扩增的反应。
当你准备对大量的样品进行DNA筛选时,在重复提取DNA过程中是否感觉耗时费力?
你有没有想过直接用原始样本材料进行PCR扩增,做提前的DNA筛查呢?
你有没有想过可以节省掉一些不必要的核酸提取的繁复步骤?
我们想到了,并且在基因分型、转基因、质粒检测、基因敲除分析、DNA来源鉴定、物种鉴定、SNP分析等领域已经广泛应用。
它就是——“直接PCR”。
一、什么是“直接PCR”
直接PCR(Direct PCR)是一种无需经过核酸提取,可直接使用动物或植物组织等材料直接进行扩增的反应。
优势:无需提取DNA,为DNA扩增带来前所未有的便捷,节约了大量的时间和成本。
直接PCR与常规PCR的主要区别是:直接PCR中使用定制的缓冲液。该缓冲液对于参与直接PCR反应的酶的耐受性和buffer的兼容性有相对应的要求。
尽管常见的样品中或多或少都会存在PCR抑制剂,但在酶和buffer的作用下直接PCR仍可实现可靠的扩增。而传统的PCR反应需要以高质量的核酸为模板进行反应,如模板中含有蛋白以及其他杂质时就会抑制PCR反应的顺利进行。
二、MN 直接PCR扩增实验方案
直接PCR的核心就是具有高度耐受的聚合酶,可直接对样本中的核酸分子进行检测。MN研发的直接PCR系列具有优秀的耐受抑制组分,有针对不同样品如动物组织、全血等PCR产品,助力快速检测。
1.小鼠组织样本
5分钟内可完成小鼠样本室温裂解和98℃热失活,取部分裂解液作为后续PCR模板,30-90min快速完成PCR检测。Master mix 含有红色染料,因此 PCR产物可直接进行凝胶电泳。
2.血液样本
可使用新型血液转移工具快速方便的将小份血液转移到PCR mix里面。部分难处理的血液样本,例如来自于兔子、小鼠、大鼠或鸡等物种的血液,通过Inhibitor Removal Pearl,实现血液分型检测。
3.植物样本
使用专利的植物样本取样工具Plant Transfer Tool(PTT)插入或穿刺叶片、花瓣组织即可得到实验需要的样本,然后将PTT浸入HotStart PCR Master Mix中即可。避免了繁琐的植物组织样本收集过程,如叶片圆盘打孔等。
在样本转移过程中,PTT上面附有的特殊涂层可以让许多植物材料中存在的PCR抑制剂在相当长的一段时间内失活。
此外,样本转移到PCR mix之后,可以在4℃到37℃环境下存放2h,然后进行PCR循环反应。
相关实验数据:
三、MN 热启动PCR 预混液
以上直接PCR扩增实验方案中,都统一使用到了同一个核心组分——热启动PCR预混液(NucleoType HotStart PCR Master Mix(2x))。
该热启动PCR预混液包含了:聚合酶,dNTPs buffer,增强剂,loading 染料 和稳定剂。
如果您的实验只需要直接PCR试剂的核心组分,可直接购买MN热启动PCR预混液。
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