完全修饰miR-34a microRNA治疗成功减缓肿瘤生长 miRNA药物再度引起关注

【字体: 时间:2023年09月07日 来源:Purdue University

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  由于p53缺陷、表观遗传沉默和基因组缺失的改变,microRNA miR-34a是临床最相关的肿瘤抑制microRNA之一。美国普渡大学研究人员合成了miR-34a的完全修饰版本(FM-miR-34a),提高稳定性而不影响其活性,克服稳定性差、非特异性递送和递送相关毒,有望让大量癌症患者从miR-34a替代中受益。

  

研究摘要

癌症几乎可以发生在人体的任何部位。它的特点是细胞分裂不受控制,甚至逃避免疫系统。miRNA是短的非编码RNA,具有同时下调多个基因的独特能力。由于p53缺陷、表观遗传沉默和基因组缺失的改变,microRNA miR-34a是临床最相关的肿瘤抑制microRNA之一,其靶点包括雄激素受体(AR)、C-MYC、AXL、MET、SIRT1、CD44、PDL-1等,可参与调控细胞增殖、迁移和侵袭、抵抗凋亡和免疫逃避的几种致癌途径。但是,miRNA稳定性降低、未修饰RNA的潜在免疫原性以及缺乏安全的递送载体,阻碍了miRNA在临床的应用前景。未经修饰的miRNA会被核酸酶迅速降解而降低活性,需要使用更高剂量和重复使用。毫无疑问,如果能够克服miR-34a稳定性差、非特异性递送和递送相关毒性,那么可能会有大量癌症患者将从miR-34a替代中受益。美国普渡大学的研究人员开发了miR-34a的完全修饰版本(FM-miR-34a)。他们的研究表明,FM-miR-34a比部分修饰的版本稳定几个数量级,而不影响其活性,对更多miR-34a靶点呈现更强抑制。FM-miR-34a有效抑制肿瘤细胞增殖和侵袭,并诱导内源性靶基因在体内传递后持续下调>120小时。通过将FM-miR-34a偶联叶酸(FM-FolamiR-34a)可实现体内靶向,能够抑制肿瘤生长,从而在小鼠中完全治愈肿瘤。这些结果有望重振miR-34a作为抗癌药物的希望,为临床试验提供了强有力的理论依据。

小分子RNA修饰

已有几种化学修饰用于稳定RNA,包括对核糖的2'-o-甲基和2'-氟修饰,以及对主链的硫代取代。核糖修饰可提高结合亲和力,保护其免受核酸酶降解,而硫代酸键可提高其对外切酶的额外抗性。2'-o-甲基修饰还有助于避免引发免疫系统刺激。不过,过多的修饰可能会改变靶基因亲和力、增加miRNA双链的稳定性而影响miRNA的沉默活性。因此,精心设计和选择一种恰到好处的修饰模式很重要,既要能增强miRNA稳定性,同时又要适合RISC加载和对靶基因抑制。

作者团队设计了一种完全修饰的miR-34a (FM-),其不对称模式包含一条22核苷酸的引导链,一条15核苷酸的互补链,这降低了两条链之间的热动力学,促进了RNA诱导沉默复合物(RISC)的链位移,这是一种用于稳定siRNA的类似模式。每条链含有2'-o-甲基和2'-氟修饰的核糖和每条链3 '和5 '端磷酸化键的交替模式,以降低免疫原性并提供外切酶抗性(图1A, B)。PM-miR-34a和FM-miR-34a双链被生成并确认。在50%的血清中孵育一段时间后,将FM-miR-34a的稳定性与PM-miR-34a和未修饰的miR-34a双链物的稳定性进行比较。FM-miR-34a在24小时内完全耐受,并保持完整至少72小时。研究人员再通过实验分别证实了以下4点:

1. FM-miR-34a的各种化学修饰不会干扰miR-34a的沉默活性;

2. FM-miR-34a转染的细胞中的转录本在表达上的改变往往更明显;

3. FM-miR-34a在体外抑制癌细胞增殖、迁移和侵袭

4. FM-miR-34a活性依赖于加载到Argonaute (Ago)

示意图来自作者原文96.png

递送方式

还有一样同样重要的,是在没有毒性的情况下实现对肿瘤组织的特异性靶向。目前实现这一目标的方法包括使用配体递送RNA——将RNA偶联到靶配体上,该配体对靶细胞上调的受体具有高亲和力和特异性。由于许多肿瘤上调细胞表面受体,如果将能与这些上调受体结合的配体设计成携带抗肿瘤弹头,可以将药物特异性地靶向肿瘤细胞。一种受体要想用于药物输送,其靶受体必须满足两个标准:相对于正常细胞,它必须在癌细胞上过度表达,并且表达水平必须足以实现治疗量的输送。叶酸受体(FR)在乳腺癌、肺癌、卵巢癌、结直肠癌和其他癌症中过度表达,满足这两个标准。

在临床上推进FM-miR-34a,需要一种特异性、操作耐受性好和无毒的递送平台。作者使用了叶酸-miRNA递送策略,能将miRNA特异性递送到过表达叶酸受体(FR)的肿瘤中,而无需将miRNA包装在载体中。在这种情况下,裸miRNA受到血清和细胞核酸酶的双重作用,从而全面评估完全修饰的miRNA在临床环境中的表现。

FM-FolamiR-34a在体内的活性评价

首先,作者验证了叶酸偶联物能够稳健且特异性地递送到FR表达细胞中。然后,将FM-miR-34a与叶酸偶联,生成FM-FolamiR-34a双链。携带MB-231荷瘤小鼠被注射单次1.5 nmol剂量的FM-FolamiR-34a或对照。接受单剂量FM-FolamiR-34a治疗的动物中,报告信号在全身注射24小时后被显著下调,并且至少在96小时内保持抑制状态。

在120h的活体成像时间点之后,收集肿瘤并评估miR-34a的内源性靶点。单次1.5 nmol剂量的FM-FolamiR-34a处理后5天,靶基因明显下调。MET和AXL在所有三种肿瘤中均未检测到,而CD44水平显著降低,证实了FM-miR-34a在体内有效沉默其生物靶点的能力。强大和持续的靶向可能是靶标和FM-miR-34a之间热稳定性增加的贡献,加上FM-miR-34a的稳定性增加,这一点突出体现在FM-FolamiR-34a处理的小鼠中收集的肿瘤中miR-34a拷贝数比对照小鼠增加了>1.5倍。

基于其突出的持续靶向性,对MB-231荷瘤小鼠进行了多剂量疗效研究。每6天通过尾静脉给予1.5 nmol的叶酸缀合物。该特定剂量和给药频率的合理依据是单剂量实验,注射后至少5天靶基因被显著抑制。FM-FolamiR-34a对肿瘤生长的抑制作用更强,产生了明显的肿瘤静态效应。值得一提的是,在21天给药期结束时,两只给药的小鼠的肿瘤缩小到初始体积的45-75%,其中一只完全治愈。而在整个研究过程中,没有观察到体重的显著变化,表明FM-FolamiR-34a的安全性。为了初步评估潜在的免疫应答,他们将FM-FolamiR-34a注射到免疫功能正常的FVB.129小鼠的尾静脉,并在注射后2小时定量血清中IL-6和TNF-α的水平。FM-FolamiR-34a未引起细胞因子水平明显高于阴性对照,而阳性对照LPS引起细胞因子水平明显升高。总之,这些结果表明,FM-FolamiR-34a在体内诱导miR-34a的合成靶点和生物学靶点更强、更持久的沉默,从而导致肿瘤生长的显著延迟。

这种分子的作用“就像汽车上的刹车”,减缓或停止细胞分裂。除了减缓或逆转肿瘤生长外,靶向microRNA-34a还强烈抑制了至少三种基因(MET、CD44和AXL)的活性,这些基因已知会导致癌症和对其他癌症治疗的耐药性,持续时间至少为120小时。研究结果表明,这种疗法是15年来针对microRNA摧毁癌症的最新研究成果,它可以单独有效,也可以与现有药物联合使用,用于治疗已经形成耐药性的癌症。

“当我们获得数据时,我欣喜若狂。我相信这种方法比目前的标准治疗要好,而且会有患者从中受益,”普渡大学癌症研究所的成员Kasinski说。


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