利用新一代测序揭示中国南方地中海贫血的多样性

【字体: 时间:2023年09月06日 来源:AAAS

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  赣南医学院的研究人员以13+万人的大规模地中海贫血筛查项目为基础,研究了赣州地区地中海贫血的患病率和突变谱。

  

全球大约有5.2%的人携带异常的血红蛋白基因。每年有30万至50万名新生儿患有严重的血红蛋白病,其中约80%发生在发展中国家。地中海贫血(thalassemia)是最常见的遗传性血红蛋白病,每一万例活产婴儿中有4.4例发生。这种疾病在地中海沿岸地区、非洲、中东、东南亚和中国南部流行。

之前发表的一项研究表明,江西省赣州市(最南端城市)的地中海贫血患病率高达9.49%,不过该研究存在样本量小、群体不具有代表性以及突变谱有限等局限性。

为此,赣南医学院的研究人员以13+万人的大规模地中海贫血筛查项目为基础,研究了赣州地区地中海贫血的患病率和突变谱。这项研究成果于2023年8月18日发表在《Human Genomics》杂志上。华大基因临床科研高级经理张文倩博士也参与了此项研究。

方法:

在这项研究中,研究人员对参与《赣州市地中海贫血免费基因检测实施方案(2019-2022年)》的136,312人进行回顾性分析。

主要发现:

1. 共发现地中海贫血携带者19827例(14.545%),其中α-地中海贫血携带者14298例(10.489%),β-地中海贫血携带者4921例(3.610%),α-和β-地中海贫血联合携带者608例(0.446%)。

2. 共鉴定出156种不同的地中海贫血基因型,包括40种α-地中海贫血基因型,42种β-地中海贫血基因型,74种α-/β-地中海贫血联合基因型。共鉴定出48个罕见的地中海贫血突变,如5'UTR +43 ~ +40 (-AAAC)、Chinese Gγ+(Aγδβ)0、--THAI、α融合、-50 G > A等。

3. 位于闽、粤、赣三省交界处的江西省东南部地区的地中海贫血患病率较高。其中,定南县和寻乌县的患病率最高,分别为18.3%和17.7%。

4. 与传统的地中海贫血基因筛查方法相比,新一代测序(NGS)技术的表现更好,特别是在鉴定新的或罕见的地中海贫血突变方面。受限于血液学分析的低灵敏度和PCR反应的缺点,传统的筛查方法会漏诊或误诊大量新的或罕见的地中海贫血变异。NGS也是一种具有成本效益的产前筛查工具。

研究人员表示,利用NGS对赣州地区进行大规模筛查,揭示了赣州地区地中海贫血的患病率和突变谱,表明地中海贫血在该地区是一个严重的公共卫生问题。这些研究结果对赣州及其他地中海贫血高发地区的预防和控制具有重要意义。

更重要的是,罕见变异和新变异的鉴定凸显了在大规模人群中选择NGS进行地中海贫血筛查的必要性和意义。

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