寻找超级马铃薯——科学家构建马铃薯超级泛基因组

　　

马铃薯（又称土豆）是世界上许多人的主要食物来源，就人类消费而言，它是仅次于水稻和小麦的最重要粮食作物之一。随着气候不断变化，对确保全球可持续粮食供应构成严峻挑战，麦吉尔大学的科学家们正在努力寻找方法，以提高马铃薯的抗逆性和营养质量。

麦吉尔大学植物科学系教授Martina Strömvik和她的团队构建了一个马铃薯超级泛基因组，以确定有助于培育下一个超级马铃薯的遗传特征。

Strömvik教授表示：“我们的超级泛基因组揭示了马铃薯的遗传多样性，以及哪些遗传性状可能被培育到我们的现代作物中，使其变得更好。它代表了60个物种，是迄今为止马铃薯及其近缘种基因组序列数据的最广泛收集。” 在此次研究中，她与加拿大、美国和秘鲁的研究人员合作。

众所周知，基因组是生物体的一套完整的遗传指令，即DNA序列，泛基因组（pangenome）意在捕获一个物种内完整的遗传多样性，而超级泛基因组还覆盖了多个物种。

“野生马铃薯物种可以告诉我们很多信息，包括哪些遗传性状对适应气候变化和极端天气、提高营养质量和改善粮食安全至关重要，” Strömvik教授说。

为了构建马铃薯泛基因组，研究人员使用超级计算机来处理公共数据库的数据，包括加拿大、美国和秘鲁的基因库。通过存在/缺失变异（PAV）的比较，他们构建了由296个品系组成的茄属马铃薯组的泛基因组，包括二倍体和多倍体。

根据研究人员的说法，泛基因组可以用来回答马铃薯进化的许多问题，这种作物是近1万年前由秘鲁南部山区的土著人民驯化的。它还有助于识别特定基因，以便利用传统育种或基因编辑技术培育出超级马铃薯。

Strömvik教授说：“科学家们希望开发出一种能够抵御各种疾病的马铃薯，并能更好地对抗极端天气，比如暴雨、霜冻或干旱。”