沙漠lncRNA HIDEN通过与IMP1相互作用和稳定FZD5 mRNA调控人类内胚层分化

　　

陆,P。杨,J。,,,,。,,T,燕,C,刘,R,肖,Y。,王,X。,和江,w . *(2023)。沙漠lncRNA HIDEN通过与IMP1相互作用和稳定FZD5 mRNA调控人类内胚层分化。基因组生物学24,1992。（蒋卫）

 

摘要

背景:大量研究揭示了lncRNAs在发育和分化中的功能和机制，但大多数研究集中在与蛋白质编码基因相邻的lncRNAs上。相比之下，位于基因沙漠中的lncrna很少被探索。在这里，我们利用多种分化系统来分析沙漠lncRNA HIDEN(人类imp1相关的“沙漠”终末内胚层lncRNA)在人类多能干细胞终末内胚层分化中的作用。

结果:我们发现沙漠lncrna在干细胞分化过程中以细胞阶段特异性模式和保守的亚细胞定位高度表达。然后，我们重点研究了沙漠lncRNA HIDEN，它在人类内胚层分化过程中上调并起着至关重要的作用。我们发现通过shRNA或启动子缺失来减少HIDEN会显著损害人内胚层分化。HIDEN在功能上与rna结合蛋白IMP1 (IGF2BP1)相互作用，这也是内胚层分化所必需的。HIDEN或IMP1的缺失导致WNT活性降低，而WNT激动剂可以挽救由HIDEN或IMP1缺失引起的内胚层分化缺陷。此外，HIDEN的缺失减少了IMP1蛋白与FZD5 mRNA之间的相互作用，并导致FZD5 mRNA的不稳定，FZD5 mRNA是WNT受体，是最终内胚层分化所必需的。

结论:这些数据表明沙漠lncRNA HIDEN促进了IMP1和FZD5 mRNA的相互作用，稳定了FZD5 mRNA，激活了WNT信号，促进了人类最终内胚层分化。

 

全文链接请见：

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-023-02925-w