计算方法揭示了突变对非编码基因组的影响

　　

不到2%的人类基因组编码蛋白质，其余的是非编码的，可能有助于基因调控。非编码基因组的突变通常会通过改变基因表达引发性状变化，从而导致疾病或残疾。然而，科学家很难从与疾病或其他复杂特征相关的众多变异中找出哪一个是因果变异，也很难理解它们的作用机制。布里格姆大学的研究人员开发了一种新的计算方法，专注于非编码基因组的小区域，全基因组关联研究(GWAS)发现，这些区域与血细胞特征的变化有关，包括淋巴细胞计数和血红蛋白浓度的降低。然后，他们扫描这些区域，寻找导致一种名为PU.1的转录因子蛋白比正常情况下更强或更弱地与特定区域结合的特定突变，并检查这种突变对PU.1结合位点的影响。他们的方法发现了69个影响PU.1结合的突变，这些突变与血细胞性状变化的数量差异有关，其中51个突变改变了PU.1的结合位点，从而可能导致生理差异。

“我们的方法可以应用于更好地理解一系列遗传条件，并帮助查明各种生物医学特征背后的非编码基因组中的因果变异，”资深作者、布里格姆遗传学部首席研究员玛莎·布里克博士说。“在这里，我们发现了非编码变异，这些变异似乎有助于血细胞特征变化的定量差异。这种方法可以用来揭示隐藏在其他复杂性状的GWAS数据中的转录调控机制。”

文章标题

Blood cell traits’ GWAS loci colocalization with variation in PU.1 genomic occupancy prioritizes causal noncoding regulatory variants