哈佛重大突破:RNA监测具有广泛的肿瘤抑制作用

【字体: 时间:2023年04月26日 来源:精准医疗趋势

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  哈佛大学重大突破:RNA监测具有广泛的肿瘤抑制作用

  


 

哈佛重大突破:RNA监测具有广泛的肿瘤抑制作用。

重大突破!哈佛大学的研究小组首次发现,RNA监测具有广泛的肿瘤抑制作用,并可能指导免疫治疗。

 

上周五,哈佛大学Leonard I. Zon和Megan L. Insco领导的研究团队在顶级期刊《Science》[1]上发表了一项重要的研究成果,让我们对细胞Know的抑瘤作用有了新的认识。

 

他们发现了一种以前未知的新型肿瘤抑制途径——RNA监视。

 

具体来说,由于细胞周期蛋白依赖性激酶13 (CDK13)突变而在细胞中富集的ptrna(转录过程中过早终止的rna)可以进入细胞质并被翻译成加速癌症进展的蛋白质。在CDK13及其下游基因没有突变的情况下,它们可以发挥RNA监视作用并降解致癌ptrna。

 

据我们所知,这是科学家首次证实RNA监测具有肿瘤抑制作用。值得一提的是,这种RNA监视过程是保守的,广泛存在于不同的物种和细胞类型中。更重要的是,在CDK13突变的癌细胞中,ptrna翻译成新抗原可能对癌症免疫治疗有益。

 

Harvard major breakthrough: RNA monitoring has a broad tumor suppressor effect

纸质主页截图

 

Zon/Insco团队的发现是一个意外的发现。

 

在研究黑色素瘤的驱动基因时,他们发现约3.9%的患者携带CDK13突变,而影响CDK13功能的突变位点非常特殊——几乎全部集中在激酶结构域。这意味着CDK13突变保留了其细胞周期蛋白结合功能,但失去了激活下游蛋白的激酶功能。这让他们对CDK13基因感到好奇。

 

他们回顾性研究了黑色素瘤患者的生存数据,发现CDK13下调或体细胞突变的患者总生存期较短。结合之前的数据,他们认为CDK13是一个重要的黑色素瘤驱动基因。

 

Harvard major breakthrough: RNA monitoring has a broad tumor suppressor effect

CDK13与黑色素瘤患者总生存率的关系

 

Zon/Insco团队还发现,所有肿瘤对于CDK13突变都是杂合的,没有发现纯合缺失。这让他们意识到,纯合子CDK13突变可能是致命的,而杂合子CDK13突变可能通过显性负作用(突变的CDK13抑制野生CDK13的功能)发挥促癌作用。在斑马鱼身上进行的研究证实了他们的猜想。

 

下一步是弄清楚CDK13突变是如何促进癌症的。

 

考虑到CDK13在系统发育上与已知的转录激酶相关,他们在转录组水平上研究了CDK13突变所带来的变化。因此,我们发现了ptrna:在CDK13突变的黑色素瘤中,ptrna明显更多。

 

此外,这些ptrna不是来自少数特定的基因,而是来自许多基因。此外,ptrna的转录断点位于内含子聚腺苷化位点(IPA, poly(a)位于内含子中)。

 

Harvard major breakthrough: RNA monitoring has a broad tumor suppressor effect

打破网站

 

IPA实际上是真核生物基因表达和转录调控的方法之一。近年来,科学家们正在研究IPA的生理功能,一些研究发现ptrna异常与癌症等疾病有关。

 

然而,Zon/Insco团队发现,ptrna在黑色素瘤细胞中的积累不是由转录本过度断裂引起的,而是由ptrna的清除不良引起的。从机制上讲,CDK13的突变导致PAXT复合物的募集和激活受损,PAXT复合物是负责清除ptrna的关键蛋白。

 

Harvard major breakthrough: RNA monitoring has a broad tumor suppressor effect

机理图

 

值得注意的是,由于ptrna包含基因内含子的部分序列,Zon/Insco团队发现细胞质中由ptrna翻译的蛋白质产物也含有内含子。因此,他们认为,这可能导致肿瘤特异性新抗原的产生。也许CDK13突变的癌症患者对免疫疗法的反应更好。

 

在研究的最后,Zon/Insco团队探索了CDK13及其下游相关蛋白突变是否与其他癌症类型有关,以及ptrna是否可以直接促进癌症。

 

他们分析了膀胱癌、结直肠癌、黑色素瘤、肺癌和子宫内膜癌患者肿瘤样本的RNA-seq数据以及CDK13突变状态的数据。总的来说,ptrna在CDK13突变的癌症中显著上调。他们还研究了TP53基因的ptrna,该基因在CDK13突变的肿瘤中明显更高。

 

与没有CDK13突变的肿瘤相比,CDK13突变的肿瘤具有更多的ptrna

 

除了CDK13突变外,其下游负责清除ptRNA的PAXT突变也具有致癌性,在17%的黑色素瘤中,PAXT复合物的成员被删除或突变。此外,一些与PAXT复合物相互作用的关键蛋白也在各种癌症中发生突变。

 

他们还在黑色素细胞中表达TP53 ptRNA,并发现它确实加速了黑色素瘤的发生;在黑色素细胞中表达膜蛋白基因SUV39H1 ptRNA也会加速黑色素瘤的发生。这进一步证实了ptRNA确实具有致癌性。

 

基于上述所有发现,Zon/Insco团队得出结论,RNA监测缺陷是致癌的一种常见机制。

 

 

总的来说,Zon/Insco团队发现了一种新的肿瘤抑制/致癌机制,广泛存在于多种癌症中,并且CDK13及其下游基因的突变频率在癌症中并不低(黑色素瘤超过20%),因此这一发现可能为癌症治疗开辟了新的方向。

 

特别是ptRNA在肿瘤中的积累可能会产生大量的新抗原,这可能对癌症免疫治疗具有类似肿瘤突变负荷(tumor mutation burden, TMB)的指导意义。

 

 

 

 

 

 

 

 

引用:

[1].Insco ML, Abraham BJ, Dubbury SJ,等。致癌CDK13突变阻碍RNA监测。科学。2023;380 (6642):eabn7625。doi: 10.1126 / science.abn7625

哈佛重大突破:RNA监测具有广泛的肿瘤抑制作用

(资料来源:互联网,只供参考)



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