eLife发布了七万四千张果蝇大脑图像

　　

   

   

来自GAL4系的果蝇大脑神经元VT032228-GAL4，用不同的颜色标记，果蝇大脑用灰色勾勒。单独标记这些神经元可以让科学家清楚地看到它们的形状。如果同一个神经元被两条不同的GAL4线标记，这些线可以结合起来，这样神经元就可以被特定地标记和操纵。

由于Janelia的FlyLight项目团队发布了数万张果蝇大脑神经元的图像，神经科学研究变得更容易了一些。

在八年多的时间里，FlyLight项目团队和合作者对超过74000只果蝇大脑的神经元进行了解剖、标记和成像，这些果蝇来自5000多种不同的转基因果蝇品系。

现在，这些图像可以免费获得，使科学家能够快速、轻松地找到他们所需的神经元，以测试神经系统如何工作的理论。

这些照片于2月23日发表在《eLife》杂志上，是数十名珍妮利亚人从2012年开始多年努力和贡献的结晶。它展示了Janelia致力于创造对整个科学界有用的免费资源。它还强调了研究园区的使命，即承担在传统研究环境中无法完成的项目，在传统研究环境中，这些长期的努力往往得不到资金或激励。

“这对社区来说是一个很好的资源，”FlyLight的项目科学家Geoffrey Meissner说，他是《eLife》上这篇新论文的第一作者。“这是Janelia的使命，它突出了项目团队的概念——做这些超出实验室合理范围的大事情——并真正强调了Janelia目标的开放科学方面。我们想要加倍努力，让每个人都能使用它，让它更容易，让它更全面。”

用果蝇做神经科学研究

果蝇(Drosophila melanogaster)是神经科学研究的主要对象。科学家们使用基因工程果蝇来定位某些神经元的表达，使研究人员能够了解哪些脑细胞控制某些行为。

当Janelia于2006年开业时，科学家们正在用果蝇来了解神经系统，但研究人员没有足够精确的工具来研究单个神经元。

这促使Janelia创建了FlyLight项目团队，他们开始创造基因工程苍蝇，科学家们可以用它来更精确地定位特定的神经元。2012年，Janelia发布了第一代果蝇菌株，第一代GAL4驱动线，以及显示大脑特定神经元所在位置的显微镜图像。

但是对于一些神经科学研究来说，第一代的线条仍然太不精确。因此，FlyLight利用分裂-GAL4方法从这些GAL4系中开发了果蝇品系，使科学家能够识别果蝇大脑中的单个神经元或单个细胞类型。

自从它们被开发出来以来，Split-GAL4系和Split-GAL4系统已经被世界各地的研究人员使用。但是，弄清楚如何创建实验所需的特定Split-GAL4可能具有挑战性。要做到这一点，研究人员首先需要标记GAL4系中感兴趣的神经元——这一任务对单个研究人员来说可能很困难。

为了提供帮助，FlyLight团队使用了一种名为MultiColor FlpOut (MCFO)的技术，该技术由Rubin实验室的高级科学家Aljoscha Nern开发，用于标记第一代GAL4驱动线中的单个神经元。生成现在发布的7万多张详细图像需要8台共聚焦显微镜超过11年的成像时间。

Janelia的科学计算团队创建了一个名为NeuronBridge的免费工具，允许研究人员搜索mcfo标记的图像，以及其他光学和电子显微镜数据，以锁定感兴趣的神经元。它还使研究人员能够预测他们在实验中需要的Split-GAL4组合。

“FlyLight制作了很多图像，但如果没有我们与科学计算公司的密切合作，这些数据就只是放在硬盘上的tb级数据，没有人可以对它们做任何事情。他们在使人们能够使用它方面发挥了关键作用”。

全球资源

在eLife上的发表标志着这些图像的正式发布，但自2020年首次发布以来，世界各地的神经科学家已经在利用这些数据了。

最近的努力建立在Janelia开发工具促进果蝇研究的声誉之上。

“一般的感觉是，对于任何研究苍蝇神经科学的人来说，想要以神经元为目标并了解它，最好的方法是使用FlyLight所特有的GAL4系。”

文章标题

A searchable image resource of Drosophila GAL4-driver expression patterns with single neuron resolution