日本科学家用一种新颖的研究方法研究深海海蛇尾种群

来自日本的研究人员为海蛇尾开发了一种元条形码技术。日本科学家在广岛修道大学和东京大学的Masanori Okanishi博士的带领下，分析了水中海洋无脊椎动物释放的环境DNA (eDNA)，并成功地确定了他们正在寻找的物种。

　　

   

   

图片:采集自日本相模海的海蛇尾

图源:Hisanori Kohtsuka(东京大学)

研究人员首次为海蛇尾开发了宏条形码技术。日本科学家在广岛修道大学和东京大学的Masanori Okanishi博士的带领下，分析了水中海洋无脊椎动物释放的环境DNA (eDNA)，并成功地确定了他们正在寻找的物种。这项研究发表在开放获取的《宏条形码与宏基因组学》杂志上。

宏条形码使研究人员能够根据环境DNA(即释放到特定湖泊中的DNA)轻松快速地识别物种并确定其在特定位置的数量。

在日本，这种方法已经被成功地用于检测海洋中特定位置的物种数量，只需对一桶水进行采样。监测物种是保护生物资源和维持其经济价值的工作的一部分，宏条形码可作为海洋生物多样性调查的一种较少劳动密集型和更具成本效益的工具。

这项新研究报告了研究团队开发的首个用于海蛇尾宏条形码的DNA引物。海蛇尾是棘皮动物门(约2100种)中数量最多的物种，使它们成为有希望进行环境DNA宏条形码的指示生物。这些海洋无脊椎动物被认为可以释放大量的环境DNA，这是由于它们的体型、庞大的种群和在各种海底环境中的栖息地。

为了确定从样本中获得并用于宏条形码的DNA序列的起源，Okanishi的团队基于相模湾60种海蛇尾物种的样本构建了一个参考DNA序列数据库。

到目前为止，宏条形码还没有用于像海蛇尾这样流动性很小的生物，因为许多参考DNA序列被错误识别或未被识别。新的数据库将有助于这项技术的进一步研究和应用。

作者在总结中说:“如果通过开发更多的引物和更丰富的参考DNA序列数据库，宏条形码成为可能，那么就有可能以前所未有的精度监测海洋环境。”

文章标题

Development of two new sets of PCR primers for eDNA metabarcoding of brittle stars (Echinodermata, Ophiuroidea)