致命的疫情：研究人员记录了中世纪数百年来鼠疫的演变

　　

研究鼠疫起源和进化的科学家们检查了来自丹麦的数百颗古人类牙齿，试图解决关于鼠疫在斯堪的纳维亚半岛的到来、持久性和传播的长期问题。

在同类纵向研究的首次研究中，研究人员专注于一个地区800年(公元1000年至1800年)，重建了鼠疫耶尔森氏菌的基因组，这种细菌导致了鼠疫，并表明它一次又一次地从欧洲其他地区重新引入丹麦人口，可能是通过人类迁徙，造成了毁灭性的影响。

这些历史样本来自全国13个不同的考古遗址的近300人。

该研究的主要作者之一、麦克马斯特古DNA中心的研究生Ravneet Sidhu说:“我们知道鼠疫在欧洲的爆发持续了大约500年，但历史档案中很少有关于它在丹麦传播的记录。”麦克马斯特古DNA中心进行了这项分析。

麦克马斯特大学的研究人员与丹麦和曼尼托巴省的历史学家和生物考古学家团队合作，深入研究了这段时间丹麦存在的不同瘟疫菌株之间的相关性和差异。

他们利用从古代牙齿中提取的片段重建了鼠疫杆菌的基因组，并对其进行了测序。这些牙齿可以将血源性感染的痕迹保存几个世纪。他们将鼠疫的基因组相互比较，并与它们的现代亲属进行了比较。

研究人员在13个生活和死亡超过三个世纪的人身上发现了阳性鼠疫样本。

其中9个样本提供了足够的遗传信息，可以得出关于鼠疫在丹麦持续存在的进化结论。研究结果描绘了一幅城市和农村人口受到无情的鼠疫浪潮打击的画面。

“丹麦社区重新引入鼠疫杆菌的频率很高，这与这一时期大多数死亡是由于新引入的病原体的假设是一致的。病原体的引入和死亡率之间的这种联系，不仅在丹麦，而且在整个欧洲大陆，都阐明了人口演变的重要方面，”南丹麦大学ADBOU的骨骼收藏馆长和古人口学家Jesper L. Boldsen说。

今天发表在《当代生物学》杂志上的分析显示，丹麦鼠疫杆菌序列中夹杂着来自其他欧洲国家(包括波罗的海地区和俄罗斯)的中世纪和早期现代菌株，而不是来自几个世纪以来从自然宿主中重新出现的单一国内群集。

“丹麦的鼠疫证据，无论是历史上的还是考古上的，都比其他一些地区，如英国和意大利，要少得多。这项研究首次确定了中世纪丹麦的鼠疫，因此使我们能够将丹麦的经验与其他地方的疾病模式联系起来，”该研究的合著者、马尼托巴大学人类学助理教授茱莉亚·甘伯说。

研究人员以惊人的细节描述了已知的鼠疫杆菌最早出现在丹麦的里布镇(Ribe)，可追溯到1333年黑死病期间，它在蒂鲁普等农村地区出现——那里没有幸存的历史证据——并在1649年消失。

它在丹麦袭击的大多数地方都是港口城市，但最后一次爆发发生在该国中部一个没有水源的小农村地区，这表明病毒是通过陆路输入的。

鼠疫是一种啮齿动物的疾病，但很明显，这些结果表明，鼠疫是通过人类携带的啮齿动物或虱子等其他媒介传播给人类的。

该论文的高级作者、麦克马斯特古DNA中心主任、Michael G. DeGroote传染病研究所研究员Hendrik Poinar说:“这些结果揭示了过去和现在的鼠疫经历之间的新联系，并增加了我们对重新出现的疾病的分布、模式和毒性的理解。”

他说:“我们可以利用这项研究和我们在研究未来流行病时采用的方法。”

Journal Reference:

1. Katherine Eaton, Ravneet K. Sidhu, Jennifer Klunk, Julia A. Gamble, Jesper L. Boldsen, Ann G. Carmichael, Nükhet Varlık, Sebastian Duchene, Leo Featherstone, Vaughan Grimes, G. Brian Golding, Sharon N. DeWitte, Edward C. Holmes, Hendrik N. Poinar. Emergence, continuity, and evolution of Yersinia pestis throughout medieval and early modern Denmark. Current Biology, 2023; DOI: 10.1016/j.cub.2023.01.064