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PacBio重磅推出Kinnex系列试剂盒
【字体: 大 中 小 】 时间:2023年12月20日 来源:基因有限公司
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基于Kinnex试剂盒,您可以高度准确地预测蛋白质,识别异构体,表征剪接事件,把单细胞UMI和barcode 追溯回特定细胞,以及实现种水平的微生物群落分析。
Kinnex试剂盒采用MAS-Seq串联的方式,通过将短的全长cDNA或全长16S扩增子串联成一个长文库,可大幅提高PacBio长读长测序系统的通量。Kinnex试剂盒包括Kinnex 全长RNA试剂盒、Kinnex单细胞RNA试剂盒以及Kinnex全长16S rRNA试剂盒三种。基于Kinnex试剂盒,您可以高度准确地预测蛋白质,识别异构体,表征剪接事件,把单细胞UMI和barcode 追溯回特定细胞,以及实现种水平的微生物群落分析。
Kinnex试剂盒可用于:
1. 基于Iso-Seq的全长RNA测序
传统的RNA-Seq将cDNA片段化后用于短读长测序(100-200 bp),必须通过算法来推断原始的转录本异构体。然而,由于可变剪切事件的复杂性,许多异构体具有高度相似的结构,推断出的转录本不准确。PacBio HiFi的Iso-Seq可对全长RNA异构体进行测序,无需进行cDNA片段化和转录本组装,能够准确检测全长异构体。
PacBio Kinnex全长RNA试剂盒
以总RNA作为起始样本,输出一个可直接用于测序的文库,您可以实现:
与典型的Iso-Seq文库相比,其通量提高了8倍。
从5'端到3'端全长异构体测序;
准确表征剪接位点;
可发现新基因和新异构体,鉴定融合基因;
获得异构体read计数信息。
2. 单细胞RNA测序
PacBio Kinnex单细胞RNA试剂盒处理单细胞cDNA可以得到一个可用于HiFi测序的文库,您可以实现:
支持10x Chromium单细胞3'试剂盒(v3.1)和5'试剂盒(v2)产生的cDNA;
与常规单细胞Iso-Seq文库相比,单细胞MAS-Seq文库可使通量提高16倍;
获得基因表达及全长isoform信息,更好地识别转录起始位点(TSS)和多聚腺苷酸化(polyA)位点;
在单细胞水平上揭示RNA异构体多样性,有助于发现新的异构体;
检测癌症中的表达突变和融合转录本。
3. 全长16S扩增子测序
全长16S扩增子测序为可培养以及难培养的微生物基因组研究提供了更全面和更高质量的数据:
减少序列相似性,检测更多的核苷酸差异,以获得更好的分类分辨率区分关键物种和菌株;
揭示样本的真正多样性。
PacBio Kinnex 16S rRNA试剂盒在保持菌种水平分辨率的基础上,用MAS-Seq方法提高了PacBio长读长测序仪的通量,您可以进一步实现:
通量提高12倍,更具性价比;
获得更高分辨率和更高质量的全长16S分析。
是什么让Kinnex与众不同?
成本效益+创新技术:基于现有的PacBio测序方法,Kinnex试剂盒允许将短片段(cDNA/16S rRNA)连接成长片段文库,优化HiFi测序,提升性价比。
基因有限公司作为PacBio公司中国区合作伙伴,自2011年以来将PacBio第三代单分子实时测序技术引入国内,一直为国内用户提供专业的三代测序系统的安装培训,技术支持,应用培训与售后维护工作,赢得客户的一致好评与信任。基因有限公司将一如既往的支持越来越多的PacBio用户。