南京大学生科院最新发文，完成了山茱萸的基因组组装

　　

山茱萸(Cornus wilsoniana, 2n=22)是中国北温带常见的灌木。春天开白色的花，秋天结紫黑色的浆果。这种树有一种独特的斑驳的树皮纹理，使它在冬天特别引人注目，为它赢得了俗称“鬼茱萸”。由于它的树皮在冬天会剥落，在中国俗称“广皮树”。枸杞子果实富含油脂，可用于提取食用油。其含油量可达55%，含有丰富的不饱和脂肪酸。与其他食用油相比，它有降血脂的作用。因此，枸杞果油不仅可以作为一种均衡的膳食油，还可以帮助控制血脂。同时，由于其较强的抗逆性，可以在造林、固沙和水土保持方面发挥巨大的作用。

2023年9月，《园艺研究》发表了一篇题为《染色体水平的基因组组装为山茱萸进化、油脂生物合成和花芽发育提供了见解》的文章，该文章由何振祥教授、陈迪君教授、陈明教授和张良波教授团队合作完成。本研究完成了黄颡鱼染色体水平的基因组组装，为该物种关键性状的进化分析和遗传研究奠定了基础。

本研究利用PacBio HiFi和Hi-C测序技术获得了C. wilsoniana染色体水平的基因组序列。基因组大小约为843.51 Mb, contig N50为4.49 Mb, scaffold N50为78.00 Mb，共注释了30474个蛋白编码基因。比较基因组学分析发现，南芥基因组经历了一次全基因组三倍扩增事件(WGT-γ， 115.86 Mya)和一次全基因组重复事件(WGD, 44.90 Mya)。研究人员还探索了金银花染色体的起源，重建了其核型进化史。共线性分析表明，C. wilsoniana与C. controversa (2n=20)具有相似的基因组结构，均属于Cornaceae的Cornus属，在12.46 Mya左右完成分化。转录组学分析发现，FAD2基因家族成员在调控金盏花油中油酸与亚油酸的比例中起关键作用。此外，利用转录组学和代谢组学技术鉴定了33个与开花过程高度相关的MADS转录因子基因。上述研究为枸杞种质资源创新和遗传改良提供了宝贵的资源。

文章标题

A chromosome-level genome assembly provides insights into Cornus wilsoniana evolution, oil biosynthesis and floral bud development