NanoDrop Eight不仅仅是一台8通道分光光度计

【字体: 时间:2023年11月16日 来源:基因有限公司

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  与传统超微量分光光度计不同的是,NanoDrop Eight内置的Acclaro™智能样本检测技术,通过化学计量算法可以检测dsDNA样品制备中蛋白质、酚、盐酸胍和/或RNA的污染,并计算矫正给出真实的的dsDNA浓度。

准确掌握核酸样品的质量和浓度对于许多生命科学应用来说是不可或缺的,并且可以减少下游实验失败的可能。比如在qPCR或测序工作流程中,苯酚浓度过高会导致酶变性或失活进而影响下游实验的成败,因此对样本进行质控对于实验的成功至关重要。NanoDrop Eight高通量超微量紫外-可见光分光光度计,仅需1-2μL上样量,支持8个样品同时检测,20秒内得出核酸样品浓度、纯度结果。与传统超微量分光光度计不同的是,NanoDrop Eight内置的Acclaro™智能样本检测技术,通过化学计量算法可以检测dsDNA样品制备中蛋白质、酚、盐酸胍和/或RNA的污染,并计算矫正给出真实的的dsDNA浓度。本文介绍Acclaro™智能样本检测技术在测定dsDNA样品中的酚和蛋白质污染物以及计算校正浓度方面的准确性和重现性。

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图1:NanoDrop Eight高通量超微量紫外-可见光分光光度计

传统上,A260/A280和A260/A230纯度比常常被用于评估样品质量。然而,某些污染物的特性不容易通过纯度比的变化来确定。Acclaro智能样本检测技术消除了对纯度比的需要,并报告存在的污染物、污染物吸收率和校正的样品浓度(图2)。

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图2:Acclaro智能样本检测技术界面,报告了苯酚污染的原始浓度、校正的dsDNA浓度和吸光度贡献。
原始光谱显示为绿色,校正后的光谱显示为粉红色,苯酚光谱显示为橙色。

按照表1将小牛胸腺DNA(dsDNA)掺入苯酚或牛血清白蛋白(BSA),并在EDTA缓冲液(TE,pH 7.6)中稀释。每个样品使用NanoDrop Eight上的dsDNA应用进行测量,每孔5个重复,每个底座1.5μL样品。以TE作为空白溶液,Acclaro软件自动计算污染物的吸光度和校正的dsDNA浓度。

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表1:将BSA或苯酚与小牛胸腺dsDNA混合并稀释以产生上面列出的浓度

使用NanoDrop One作为参考计算NanoDrop Eight的平均校正浓度和百分比误差,如表2所示;NanoDrop Eight 的通道间变异性数据如表3所示。

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表2:NanoDrop One和NanoDrop Eight分光光度计计算的校正浓度的比较,NanoDrop One作为百分比误差的参考。

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表3:NanoDrop Eight 的通道间(基座A-H)可变性,每个通道五次重复测量的平均值。

如表2数据表明,Acclaro智能样本检测技术在仪器之间表现出高再现性,百分比误差低于10%,在大多数情况下低于5%。

如表3数据表明,通道之间的可变性较低,蛋白质和苯酚的标准偏差均低于1.5ng/μl,这表明Acclaro软件在确定校正的dsDNA浓度方面具有良好的再现性。

NanoDrop Eight分光光度计使样品质控变得简单,并且可以无缝集成到qPCR和测序样品制备等工作流程中,内置的Acclaro软件可以帮助用户准确评估样品,避免用户仅凭纯度比值对样品质量的疑虑,本文数据充分说明Acclaro软件在测定dsDNA样品中宽浓度范围的苯酚或蛋白质污染时的高精度和再现性。

NanoDrop Eight,仅需要1-2μL上样量,支持8个样品同时检测,20s内得出结果,多种质控方法可供选择。

1. 内置Acclaro智能样品检测技术,可以分析核酸中的蛋白质、苯酚、盐酸胍、胍盐等污染,自动计算并校正给出真实的核酸浓度。

2. 可选FDA  21 CFR Part11软件,满足合规性要求。

3. 支持蛋白浓度检测和光谱扫描等应用。

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基因有限公司自2004年成为NanoDrop Technologies公司(2007年被Thermo Fisher Scientific公司并购)在中国区的合作伙伴,至今已有近20年的合作历史,负责NanoDrop全系列产品线的售前咨询、售后安装、应用培训和维修维护等服务。目前在中国有数万台装机,服务了几十万用户。


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