李法美尼综合征患者可通过液体活检更早发现癌症

　　

一项新研究发现，一种分析基因组、片段组和甲基化组的游离DNA血液检测有望更早检测出李法美尼综合征患者体内的癌症。李法美尼综合征（Li-Fraumeni syndrome）是由生殖细胞中的TP53突变引起的，其患者在一生中容易罹患各种癌症。

加拿大病童医院、安大略癌症研究所、玛格丽特公主癌症医院等机构的研究人员于本周在《Cancer Discovery》杂志上报道了这一成果。

研究人员对193份血浆样本中的游离DNA（cfDNA）进行了回顾性分析，这些样本采集自89名带有生殖系TP53突变的成人或儿童，他们患脑瘤、乳腺癌、肾上腺皮质癌、软组织肉瘤或骨肉瘤的风险增加。

42名参与者接受了长期检测，每个人提供了2个到11个样本，而其他人只提供了一个样本。在这89名参与者中，有26人患有活动性癌症，而18人最初未患癌症，但后来发展成一种或多种癌症。

研究人员采用基因组合测序、低深度全基因组测序和游离甲基化DNA免疫沉淀测序（cfMeDIP-seq），在患有活动性癌症或随后确诊癌症的个体血浆样本中寻找肿瘤突变、拷贝数变化、癌症相关的ctDNA片段化模式和甲基化标志物。

通讯作者、玛格丽特公主癌症医院资深科学家Trevor Pugh称，这种方法能够检测血液中多个不同类型的DNA变化，而这些DNA变化预示着癌症正在体内某个位置形成。

在机器学习的帮助下，研究团队缩小了与早期癌症相对应的血浆标志物范围，其阳性预测值为67.6%，阴性预测值接近97%。在被归类为无癌症的个体中，他们发现阳性预测值略高于54%，阴性预测值超过95%。

此外，研究人员在分析时还发现了一些线索，可以预测癌症发生时的主要部位。值得一提的是，他们发现，与无癌症或患其他癌症的个体相比，乳腺癌患者样本中的差异甲基化区域往往甲基化程度过高。

肿瘤学家、病童医院的癌症遗传项目主任David Malkin表示：“一直以来，我们都没有很好的方法对癌症患儿或易患癌症的儿童进行监测。现在，我们可以通过简单的血液检测来确定癌症是否发生以及时间和地点。”

通过综合现有的数据类型，研究人员提高了cfDNA方法在癌症监测上的灵敏度。这种方法能够从早期癌症患者的一半样本中准确发现癌症线索，而在少数晚期癌症患者的样本中，这一比例上升到近92%。

根据这些结果，作者认为这项工作“为李法美尼综合征患者提供了一个框架”，不过他们提醒说，“将液体活检纳入目前的监测还需要进一步的临床验证”。

“与目前的临床监测方法（如成像）相比，液体活检利用一种整合的游离DNA分析方法，能够更早地检测出李法美尼综合征患者体内的癌症，”他们写道。“液体活检提高了可及性和灵敏度，与目前的临床监测方法互补，可为患者提供更好的治疗。”